Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0000900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0008573 hsa_circPTPN14_018 hsa-PTPN14_0009
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214537855-214551445 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214364512-214378102 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-293.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -309.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 215.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((.(((((((.(((((.............))))))))((((((((((((..(((.(((.(..((((((((((((.((((..........)))).)))))).(((((((((((..(((((..(((((((((((((((....)))).................(((((..((((((.......)))))).)))))...(((((..((.....)).))))).(((.((((((((.((........)).))))..(((.((((((((...(((.(((.......))).)))......((((((...................................(((.((((((((((((((.((((((((((((((....((((........)))).......))))).)))).......))))).))))........))))))))))))).(.(((((.((((.....)))).))))).)..........(((((.(.........))))))((..((((......))))..))......)))))).((((....))))((.(((..((...))..))).))....)))))))).))))))).)))........((((((...))))))))))))))))).))...)))....))).)))))))).......))))))..).)))..)))..)))))).....))))))...(((((((..(((.....))).))))))).((((((((.((.((((.((..((((((...((..((.((((.((...(((....)))..)).)))))).))...)))))))))))))).))))))))..(((((.......))))).....)))).)))))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,....((((((.((((,((.(((((.,,,.,,,.,..,||}|||}|(((((({{{{||,,|{{.|||.|},||{|||{|||{|,{(((.,....,...||}}.}}}}||.(((((((((((..(((((..(((((((((((((((....)))),.......,,.......(((((..((((((.......)))))).)))))...{{{{{..((....,|).}}))}.(({.{({,((((.((........)).))))|,,{{.((((((((,..{((,((({,,..,.|}}.}|||..{{.{,{{{{...,,..,,.............,,},.,,|.,...(({{((((((((((.,{{.((({,(((((((((....((((........)))).......))))).))))..}}}.{||||......,}}}}}..))))))))))))).|},((((.,,{{{{((((((((|..{{,{.,.{,.,..,(((((.(.........))))))((..((((......))))..))......}.,))).||,},).))))))}..}}}.,.}}})..|||...,))}.)))))))).))}})}}.,)),.......((((((...))))))})))))))))))))...,,,....))).)))))))).......,}}}}},.||}|}..}}}..)))),)}}}..,}}}},...(((((((,.(((.....))),))))))).((((((((.{(.(({{,((..((((((,{,(,..((.((((.((...(((....)))..)).)))))).}},},)))))),))))))}.))))))))..{|||{,,,,,,,)))))},.,.)))).)))))),,,..........
Forensic Context

No forensic context available.