Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0016444 hsa_circPTPN14_014
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214549562-214558131 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214376219-214384788 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-627.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -656.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.((((((((....))))))))))((((....((((((.((((....(((....................))).((((((....))))))((.((...((((((...((((((((((.(((..((((((...............(((((.....((((......(((((((.....))))).))......)))))))))((((......((((((((((.....((((((...))))))((((...((((((..(((((..((((((.....)))))..........)..)))))...(((....)))...((((.......(((((.(((..(((...(((((((..(((((...(((............))).((((((.........))))))...(((((((((((.((((((((((.(.(((..((((((...((((..((.(((.......((.(((((.....))))).)).((.(((((........)).))).))........(((((((..((((((((((((.....)))))((((..(((((((.((........((((...(((((..........((((.(.....).)))).((((......))))..((((.................)))).....)))))..))))...((((.((.(((..((..((((.((......))..))))..)).))).))..))))......(((((((...(((...)))....)))))))....)).)))))))..))))((((((((...((((((((..(((.(((......((((((((............)))..))))).....))))))..))))))))))))))))...)))))))(((((((((.((....(((......))).((((.(((((.(((..(((((.((.....))...((((((.((((((((((......)))).............))))))...))))))...((((((....(((.....)))...)))))).....((((.......))))))))).))).))))).))))..((.(((.((......)).)))))....)))))))))))(((.((.(.(((.((.(((.(((..(((...)))))).))))))))).))))).....))))))).)))))..))))))))))))).).))))))......))))......(((........))).))))..)))))))..((((....)))))))))((((((((((((((......)))).....))))))))))..((((((((((........))(((((......))))).......((((...))))(((.((....))..))).))))))))........(((....)))......((.(.((((.((((((.((.......)).)))))).)))).).)).)))))))...)))..)))))))).........)))).))))))))))......((((.(((.(((((((...)))))))..))).))))))))))))))))))...))))))...)))....)))))))))).....((((((...(((((.....)))))))))))....................(((((..((((((.......)))))).))))).........((((..(((((.....(((......))).))))).....)))))))))).)))).....))))))))))......((.((((.((.(((((...(((......................)))..))).)).))..))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((.{{{(((((,,..}|||}||}||{{{{,.,,{{,,({,(({{....(((.....,,,......,,,...))}.((((((....)))))).||({{..{{{{{|,,.((((((((((.(((..{{(((({{,..{,..,.{{{{((,,,...{{(,.,.......,,,|||....,))))).)}}}....,))))))),{,{{......(((((((((({,..,(({((,,,.||||||((((...((((((..(((((..((((,.,.,..|,,}},..,..}}}}...)))))...(((....)))...((((..,{...(((((,{((..(((.,.(((((((..{{(((.,{{{(,{..,{,{((,,,}}.,}})))},....{{.,|||}...,((((((({(((.(((({(((((.(.(((..{(((((...{(((,,((.({(.......((.(((((.....))))).)).((.(((((........)).))).))......{,{((((((..(((,,....}))....{{,{(((...({((.{(({{((....((({((({..{((({{{..........||..((((..(((((..{(((......)))}..((((...,.............))))....(((({{((((((..,((((.{(,(({..((..((((.((......))..))))..)).)}),))..)))).}.,(((((,(((....((((.((,,...,,,,,)).})))....))),))))).}((((((((...((((((((..(((.(((......((((((((............))).}})))).....))))))..)))))))))))))))).)).))))))))))))))..)))).{(((......)))}((((.(((((.(((..(((((.((.....)}...((((((.((((((((((......))))..{,...}}....))))))...))))))...((((((....,((,....,))}}.)))))).....((((.......))))))))).))).))))).)))),,((.(((.((......)).)))}}....||||,{((((((,,......}||}}}}..,})))))}}}}}})}}))).)))),..)).)),),.....)))))))})))))..))))))))))))).}.)))))}|},...))))}}},{{(((.{{......)).))))}.)))))))..{(((....)))})))))((((((((((((((......)))).....))))))))))..{((((((({{,,,,....}}(((((......))))).,,,...{{||...}}}}(((.{(....))..})).)))))))}........(((....)))......((.(.((((.(((((({((....}}})),)}}})).)))).).)).))))))).,.)))..)))))))).,,......)))).))))))))))}}}.,,,{{{,(({,||{|||,,,,,})}}},..))},))}))))))))))),}||...}))))),..)))....))))))))))...,.((((((...(((((.....))))))))))).,.........,,.....,,(((((..((((((.......)))))).))))).........{(({..{{{|{,,,,,{((...,,.|||,}||}}.....}))})))))).)),}...}})))))))))){.....{{.({{{.{{,,{(({...|||.,....................}}},,},}.,,.,},.)))),....,,,)
Forensic Context

No forensic context available.