Basic Information
Symbol
hsa_PTPN14_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0016446
hsa_circPTPN14_013
hsa-PTPN14_0007
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214556654-214560265
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214383311-214386922
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-546.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-569.76 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
407.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((..((((.........))))(((((.((((((((..(((.((((.((.............)).)))).)))..))).((.((((((((....))))))))))....((((((.....(((((....((((((((..............((((((((......((((.((.((((.......))))))))))(((((.((..(((...(((..(.(((.....((((((((((...((((((.....(((.....)))((((((.......((((((((..........((((.((.(((...((((((...)))))).((((((..((.......))...))))))...((((((.(((.(((((.(..((((...(((....))).....(((((.....))))).....))))..).))))).....((((((((...((((((((((...)))))).........((((((((.(((((((..(((((((....(((((((....)))..)))).(((((............((.(((((.....))))).)).((.(((((........)).))).)).........((((((..(((......)))....(((.(((........))).)))....(((....)))((((.((..........))...))))....((((((((......)))).))))....))))))........(((........))).........((((.((.(((..((..((((.((......))..))))..)).))).))..)))).)))))))..)))))..)))))(((....))).(((....)))..)))))))))).((((((((...((((((((..(((.(((......((((((((............)))..))))).....))))))..))))))))))))))))....))))...)))))))).))))))))))))...)).))))..........)))))))).......))))))((((((.((((((((((......)))).............))))))...))))))...((((((....(((.....)))...))))))((((.((((..........))))..)))).))))))..))).)))))))...))).)..)))..))).((((........))))...)).)))))))))))))..(((.(((((((....(((...............))).)))))))))).....))))).))).....)))))))))))((((((((((((.((......)).))))).....((((.((((....)))).))))((((((((((((((......)))).....))))))))))..((((((((((........))(((((......))))).......((((...))))(((.((....))..))).))))))))....)))))))))))))).))).)))).)(((((..(((((((....))))))).((((((..........)))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((.{........}.)))))),({{.(((((((,,(((({{(({{,....,,}|...,}}}|}|}...((((.(((({.((((((((....)))))))))}..))).))))..{{{{{......(((,,.,.,,,,.....,,,...}||.((((({....}))))),|{}},,.))),,(((((.(((..((((.(((...(((((({..{{,,(,({((((.....,(((.............|}}....}))))).}}))}....})}(((((({.....{{{{{.(((...)))...((((((...)))))).,,.(({((((....(((((..{{{{|,|...,||,|},..,..}}}}...)))))..))))..}}}.(((((((.{.({,,((({.((((....)))}..........{{(({.,{{,(,,..,,,{{{,,,}}.,}})))}}...,|,.,,,}},,.,(((((({{(({.(((({(((((.(.(((..{(((((...{(((,.((.({(.......((.(((((.....))))).)).((.(((((........)).))).))......{,(((((((..(((,,....}))....{|,{(((...({((.{(({{((....((({((({..{((({{{..........||..((((..(((((..{(((......)))}..((((...,.............))))....(((({{((((((..,((((.{(,(({..((..((((.((......))..))))..)).)}),))..)))).}.,(((((,(((....((((.((,,...,,,,,)).})))....))),))))).}((((((((...((((((((..(((.(((......((((((((............))).}})))).....))))))..)))))))))))))))).)).))))))))))))))..)))).{(((......)))}((((.(((((.(((..(((((.((.....))...((((((.((((((((((......))))..{,...}}....))))))...))))))...((((((....,((,,...,)),}.)))))).....((((.......))))))))).))).))))).)))),,((.(((.((......)).)))})....|||,,{((((((,,......}|}}}}}..,})))))}}}}}})}}))).)))),..)).)),),.....)))))))})))))..))))))))))))).}.)))))}}},...))))}}},{{(((.{{......)).))))}.))))})},.{(((....)))}))))){{((((((((((((......)))).....))))))))))}}})||.,})})))))))..))|||,,....}}))))).(((.....))}{((((.(((.{(....))..}))..))))).......))))..,))).)))).))))))))((((.{,(((((((....)))))}),}}}}.}})}}}}}}.)))).))).}.))
Forensic Context
No forensic context available.