Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0003100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0016450 hsa_circPTPN14_006
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214560187-214588069 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214386844-214414726 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-191.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -204.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((......))).).))(.....((.(((((.((((.((.((....((((((((((((.(((((.....(((((((.....)))))))..((((((((((.(((...))).))))))))))((((((.((.....))..))))))....((((..(((...)))..)))))))))....(((((((((...((.((((.((.....)))))))).)))))....))))....((((....))))((((....))))..))))))))))))......((((..((((((.((((...((((((.((((...(((((((((((((...(((.((............)).)))....))))))))))))).)))).))...........(((.((((((.(((.(((((((.(((.((.((..(((((........)))))..))..)).))).......(.((..(((((......((((((......))))))......)))))..)).).........)))))))..))).)))))).)))..........(((((......)))))......((.(((....))))).....))))....)))))))))).))))...(((((.((.((.....)).)))))))..((((.........)))).)))).))))..(((((((((.....))).))).)))...))))).)).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,(((......))).|.}}(.....,{.(((({.{({{{((.(,....((((((((((((.((((({,...((((({(,.,,.}}}}|||,,((((((((((.(((...))).))))))))))((((((.,(.....,}..))))))....((((..(((...)))..))))}}}}}..,.(((((((((...((.(((,,((.....)))))))).)))))}...,)))},||||{|...,)})}((((....))))..||||||}}}}}}...,..{(((..((((((({(((,..(((((({({,,...{{|||||,{{(((.,,{(,.((,,,.,{{{,...,},|||{,,,||||||||||},,.,}))|)),}},.,,,,..(((.,((({(.(((.{{(((((.(((.({.{{..(((((........)))))..,..,)).})),,,,...|.((..(((((......((((((......))))))......)))))..)).}..,,,,,,.))))))).}})).)))))}.))}..........(((({......})}})....}}||..|||,,,.,))}..}},}))}....}))))))}}).)))).},|||||.{|,||,....||,||}}}})},|,||..},,,,}},))},}})).}))}.,|{{{(((((,,..,})},}},.)},...))})).)}..,..)
Forensic Context

No forensic context available.