Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0003600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0016453 hsa_circPTPN14_008 hsa-PTPN14_0018
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214564331-214585094 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214390988-214411751 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-133.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -143.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((((......))))....)).)))))))....(((((((.((..(((.........((((((.((..(((.....(.((((((...((.((((.((.....)))))))).))))))).....)))..)).))))))...((((....))))..((((((.........(((.((((..((((((.(((((((..(((((........)))))...((((((((..((((...((((((...(((((((((((..(((.(.....((((((...........(((((((...(((((........(((.((.((..(((((........)))))..))..)).))).(((....))).(((.((......)).))))))))..)))))))))))))).)))..))))))))))))))))))))).))))))))..............(((((......))))).)))))))..))))))..)))).))).........))))))...((((.....)))))))..)).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((({((((.....{{{|...}}}}))))))))))....(((((((.((..(((.........((((((.((..(({....,({((((((...((.(((,,((.....)))))))).)))))),...}}))}..)).))))))...((((....))))..((((((.....,,..{{{,||{|.,((((((,{(((((({,(((((,.....,,}}}}|.,,{((,,,{(..(({{,,,{{{{....|,{{{{{{,{((||(((|||....}))}))}}},,,,,...{((.,((({{.(((.{{{{{{{.(((.({.{{..(((((........)))))..,..,)).})),,,|,..,.((..(((((......((((((......))))))......)))))..)).},,,,}}},,))))))),}}}),)))))},)),....,,....{{{{{......}}}}).,}}))}}..}}}}}).,)))}.))),,,,.....))))))...((((.....)))))))..)).)))))))
Forensic Context

No forensic context available.