Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0552500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0049
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:214524113-214524474 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214350770-214351131 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-119.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -126.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 66.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.......))).).)(((..(((((..((((.((((.(((((((((((((((((...(((((((((((((......))))))((((.....))))(((((((((.(((((((.............))))))).......))))))))).(((..((.(((((((((.(((((.(((......))).))))).....(((((((((((((......(((.(((((.........................))))))))..))))))))))))).............))))))))).)))))((((....))))..)))))))))))))))))))))))).)))).)))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.......))).).)(((..(((((..((((.((((.(((((((((((((((((...(((((({((((,,...}}}),,||(((((,...,||}||((((((({.{(((,........,,.....|||,,,....,},,))))))))},(((..{{.(((((((((.(((((.(((......))).))))).....((((((((((((({{,,,.{{{{(((((......,,.................}})}))))},))))))))))))).............))))))))).}.})){{{{...,))))..)))))))))))))))))))))))).)))).)))).))))))))
Forensic Context

No forensic context available.