Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0001000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0026
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214537855-214560265 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214364512-214386922 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-858.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -899.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 607.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.