Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0552700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0029
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:214549575-214557211 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214376232-214383868 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-333.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -350.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 289.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......((((.(((...........(((((....))))).........((((((...))))))......)))))))(((((((((...(((((((((.((((.((...)).)))))))))))))....(((((((((...(((((.((.(((((...))))).))..)))))................(((((....)))))...(((((((((.(((((((.((((((......((((.((((..........)))).))))))))))(((((((........(((((........)))))......((((.....(((((((......((((..........((((((..((.(((.............))).)).....))))))........))))..)))))))......)))))))))))....((((.(((..........)))..)))))))))))...)))))))))..))))))))).....)).))))))).(((((((.(((((.(((....)))..))))))))))))))))(((....(((((((((.((((..((.(((((((.((..(((((((((.(((((((((.((((((.((((........(((((...)))))........((((((...(.(((((.((((((((..(((........))).))).)))))))))).)..)))))))))))))))).)))))))))..))))...))))).)))))))))))......((((.(((((((((......)))))))))...))))..)))).....((.(((((((...((((((..(((((((........((((((.......))))))))))))))))))).....))))))).)))))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,...,{,,{(({(((......,,..,(({{(,...||}},......}}.,{{{{,,,,))))}).,....|}||||,,{((({(({,..(((((((((.((((.((...)).)))))))))))))....||{{{{{{{...(((((.((.(((({...))))).))..))))).,,,,,.{{..,,,,,.,{{((({,{{||,...,,,{{,,{{.{||||||,((((((......((((.((((..........)))).)))))))))){{{{(({,,,.....(((({........))|||,....,{{{(,,...(((((((...,,,{{{(......|}||,,,{{({....,|,,..............}.}},,,..,})))}........,})},.)))))))......}}})))}}|}|....(((({(..{{{..,,....)},})).))))))}},},}))))))))},))))))))),..|||}.))))}||{(((((((.(((((.(((....)))..)))))))))))),}))|||||,,|||{|{{,,,,|||,.{{.(((((({{((,.(((((((({.(((((((((.(((((,,((((....,,,.{{{,{,,.,}}}},.,,.,}}((((((...{.(((((.((((((((..{((.....,}.))).))).)))))))))).,..)))))))))))))))).)))))))))..))})...))))),))))))))}}|,{{{..((((.(((((((((......)))))))))...}))),|}}...,},,,}}}}}},.,,)))))))}}))))}}(((((((((((((((((,,((((..((((((...))))))..)))).).)))).))),))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.