ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_chr1_0552800
Basic Information
Symbol
hsa_chr1_0552800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0038
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:214557212-214557498
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214383869-214384155
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-137.80
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-143.03
kcal/mol
Frequency:
0.0002
Diversity:
33.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((.((.......)).)))).((((((.(((((((..(((((((((.(((((((((((((((..((((((.......)))))).(((.(((((((((((..(((((((..((((((((((.((((.(((.(.....((...))....).))))))).)).)))).........)))).)).)))))..))))))))))))))(((((((((((((.(((....)))))))))))).)))).))))))))).).)))))))))..))))).)).))))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((.((.......)).)))).((((((.(((((((,.(((((((({{(((((((((((((((.{((((((.{....}))))))}{((.(((((((((((..(((((((..((((((((((.((((.(((.,.....({...}}....,.))))))).))},))).........)))).)).)))))..)))))))))))))}(((((((((((((.(((....)))))))))))).)))).))))))))).).)))))))))..))))).}),))))).)))))).
Forensic Context
No forensic context available.