Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0064
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:214575028-214625317 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214401685-214451974 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-143.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -152.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 123.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((....(((((((((((((((((((((...(.(((.(......).))).)...))).))))))))...))))..((((..(((((.((((......((((....)))).......))))..))))).)))))))))))))))(.(((((((.....)))))))..........(((...(((.(((((((.......)).))))).))).....)))((((((((((((.(((((.....(((((((.....)))))))..((((((((((.(((...))).))))))))))((((((.((.....))..))))))....((((..(((...)))..)))))))))....(((((((((...((.((((.((.....)))))))).)))))....))))....((((....))))((((....))))..))))))))))))....(((((.(.(.....).).)))))..(((((........)))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,((,,...,,{|||{{{,(((((((((((...(.(((.{......}.))).)...)))}}))))))).,,{{({{.,{{({{(({({,{{(((({..,{|((,{{{|||}....,||||{{{{{{..,{||||,,,,,))))),|}|||||||},,.,))))))}...,......{{{,,.(((.(((((({.......}}.))))).})),.,}.}}}((((((((((((.(((((.....(((((((.....)))))))..((((((((((.(((...))).))))))))))((((((.,(.....,}..))))))....((((..(((...)))..)))))))))..,.(((((((((...((.(((,,((.....)))))))).)))))}...,)))}.||({({...,)))}((((....))))..)))))))))))).....,,,,,,,,}})})),))},)))},{((((......,,)))))..})
Forensic Context

No forensic context available.