Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0553000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0059
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:214576846-214577244 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214403503-214403901 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-126.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -130.67 kcal/mol
Frequency: 0.0005
Diversity: 54.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((.((((((((....))))).....)))))))))........))((((((...((((((((((..........((((...((((((..((......))..)))))))))).....(((((((...........)))))))...))))))))))......((((((((....((((...((((....((((((((((.(((.(((.((..(((((((((....))).......(((...........)))..)))))).........(.((((((((((..........))))).))))).)(.((((.((((((....)))))).)))).)..))))).))).))))))))))....)))).......))))..)))))))).)).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((((.((((((((....))))).....)))))))))........))((((((...((((((((((..........((((...((((((..((......))..)))))))))).....(((((({..........,)))))))...))))))))))......((((((((....((((...((((....((((((((((.(((.(((.((..(((((((((....))).......(({.......,,..)))..)))))).........{.((((((((((..........))))).))))).}(.((((.((((((....)))))).)))).)..))))).))).))))))))))....)))).......)))),.)))))))).)),,).))
Forensic Context

No forensic context available.