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hsa_chr1_0553000
Basic Information
Symbol
hsa_chr1_0553000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0059
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:214576846-214577244
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214403503-214403901
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-126.00
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-130.67
kcal/mol
Frequency:
0.0005
Diversity:
54.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context
No forensic context available.