Basic Information

Symbol
hsa_PTPN14_0006400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0055
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:214672548-214673353 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214499205-214500010 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-182.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -200.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((((((.((((((((.....)))))))).))).))))...)))(((............(((..((((.(((((((....)))))).).))))..)))....((((((((((.((((..(....)..)))).))))))))))..((((.(((((((.((((((..(((((((((((..(((.......))).))))).....)))))).(((((.(((.......((((((((((((....((((..............))))..))))))))))))))).))))).........(((((((((.(((.(((((.((.............)).))))).))).))..))))))).......(((((....)))))((((....)))).((((((((((((........((((((((..((((((((((((((((((.....)))..)))))))))))))))...))))))))........)))))))(((.(((((...((((..((((..........(((...)))(((((.(((........)))))))).((((..(((.......)))..)))).....))))..))))...))))).)))((((((((....))))))))...))))).....................(((.((((.......((((..(((((....))))).))))....)))))))..............)))))).))))))).))))..........((((.......))))((((((((((.........))))).)))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(({,,,.,{.||.((((((((.....))))))))((((((,|{{....}}},.})}}}},....(((..((((.,((((((....)))))).,.))))..)))....,,((((((((.((((..(....)..)))}.)))))))),}..((((.(((((((.((((((..{(((,,,,,,,.,(((.......,,,,||||,,{{,,|||||}.{||||,|||,..,...((((((((((((,,{{(,,.............,,)))}..))))))))))))}}}.}}}}}..,,,....{{(((({{{,{{{.(((((.((.({.......,}.)).))))).}}},}},.})))))}...,,,{(((((....))))}|{{{....}}},.((((((((((((.....,,,((((((((..((((((((((((((({{{.....}))..)))))))))))))))...))))))))...,,,,.})))))}{((.(((((...{(((,.((((..........{({...)}}((((,,(((........))))))))...,,,,{{(,,,.,,,.,,.,}},,..,,,))))..))))...))))).))}((((((((....))))))))...))))).............||,......|}}.,.({{....{((((..(((({....))))).,)))}}....))}})}}.,,,..}}}.,.)))))).))))))).)))).,,,......,{{{......,)}||((((((((((.........))))).)))))},..,}
Forensic Context

No forensic context available.