Basic Information
Symbol
hsa_PTPN14_0006800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PTPN14_0019
Host gene
PTPN14
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:214717266-214717832
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:214543923-214544489
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-162.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-175.07 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
92.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.((((((.((((((((((.............(.......)...............(((((((((...)))))))))..)))))))).)).)))))).((.(((((((((.....(((((.(((((((((((((.((..(((((..(((((..((((...((((..(((((.(((...))).)))))...))))...))))...............((((.(((...(((...)))...))).))))((((((..(((.....))))))))).....(.((((((..((((((((....))))))))..)))))).).(((.(((((......))))))))..........((((.(((........))).)))).((((........))))..............((((((...........................))))))......))))))))))...)).))))))........)))))))))))).....))))))))).)).......))))..(((((.(((((((.(((....))).)))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{{.,.((((((.((((((((((.............(.......,...............(((((((((...)))))))))..)))))))).)).)))))).((.(((((((((.....(((({,(((((((.(((((.....||||}.,,{{{{..((((...(((({.(((((.(((...))).))))).}.})))...)))),{{{{,...,}}},,{(((.(((...(({...}))...))).)))}((((((..({{.....}),)))))).....{.((((((..((((((((....))))))))..)))))).,.(((.(((((......))))))))..........{{{{.(((......,.))).}))}...{{.{{{{..,||{.,.....,.,}},}}|||{||.....,.........,.,{,,,|||..}}}}}}.....,)))))))},}......,},,,,....}}},)))))))))))).....))))))))).)).......,|}|..{{{,|.(((((((.(((....))).))))))}..,}}}}
Forensic Context
No forensic context available.