Basic Information
Symbol
hsa_PVT1_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085536
hsa_circPVT1_001
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
8:128806779-128903244
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127794533-127890998
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-307.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-320.89 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
215.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((..(((((((((((.(......))))))).((((.((((((.....)))))))))).(((((((.(((..((((...((.(.(((((((..(.....(((.((((((((((.((((((((((((...((....))....)).)))).)))))).))))))......(((((....)))))((((.......((((((((((.((((.(.(((((((((((.(((((.((....(((((.......((.(((((((((.((((((((.((((((.(.......))))))))))(((.((.(((...))).)).)))...........(((((((((...))))))))).))))).)))))))))))((((((((.......)))))))).........)))))..)).)))))...)))))..)))))).).))))..(((((.(......))))))((((.(((((......))))))))))))))))))).......))))(((((((((...((((((((...(......)...))))))))..........)))))))))...(((((...........)))))(((((((((........))).)))))))))).)))...)..))))))).).))....(((.(((((((..(....)..))))))).))).((((((...(((...)))...)))).))....))))..))).)))))))...((((...)))).)))))..))))).)((((((...)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((..(((((((((({{(......))))))).((((.((((((.....)))))))))).(((((((.(((..(((((.,{,.(.{(((({,,||.....{{{,(({{((((((.((((((((((((.{,((....))..,}))}}})).)))))).)))))).....,({(((....))))|((((...,,..((((((((((,((((.(.(((((((((((.(((((.({..,.(((((...,...,{.(((((((((.((((({((.(({(({,|..,..{{}|||||||||((,.,|}|,|}}})))})).))),,,.}}}....{((((((((...}}})))))).))))).)))))))))}|{(((((((.......})))}))),....,...)))))..)}.)))))...))))},.}))))).).))))..(((({.(......})))))((((.(((((......)))))))))}))))))))).......)))){{{{{{{{{.,.((((((((...{......),..))))))))....,.....)))))))),.,|{{((({{{{{,....,,||||{{((({{{{........)}}.}))))})))).)}}..,}.}))))))).}},,{{..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..}||||.,,(((,,.}))...))),.}}..}.))))..))).)))))))...((((...)))).)))))..))))).)((((((...))}})))
Forensic Context
No forensic context available.