Basic Information

Symbol
hsa_PVT1_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085538 hsa_circPVT1_003
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
8:128806779-129082518 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127794533-128070272 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-548.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -575.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((......(.(((((((((((((((....((((((((.......))))))))(((((((((((((.(((..((((...((.(.(((((((..(.....(((.((((((((((.((((((((((((...((....))....)).)))).)))))).))))))......(((((....)))))((((.......((((((((((.((((.(.(((((((((((.(((((.((....(((((.......((.(((((((((.((((((((.((((((.(.......))))))))))(((.((.(((...))).)).)))...........(((((((((...))))))))).))))).)))))))))))((((((((.......)))))))).........)))))..)).)))))...)))))..)))))).).))))..(((((.(......))))))((((.(((((......))))))))))))))))))).......))))(((((((((...((((((((...(......)...))))))))..........)))))))))...(((((...........)))))(((((((((........))).)))))))))).)))...)..))))))).).))....(((.(((((((..(....)..))))))).))).((((((...(((...)))...)))).))....))))..))).)))))))...((((...)))).))))))..(((((.....)))))))))).)))).)))))).)))))))((((....(((.(((((...((((((((((.(.......((((.......(((((((.(((.(((((........))))).))).))).))))))))((.(((((..(.(((((..(((((((((((((((((....((((((((.....))))))))((.((((((.((.(((..(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..))))))).)).)))).((((..(....)..)))))))))...))).)).)))))).))))))))................)))))))..))))...))))).)..))))).)).((((..........))))....(((((((...(((.(((......))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).))))))..((((((((.......))))))))))))..(((((((((...(((((((.(...((((..((((...((((((.........))))))....))).)..))))...).))))))).))))))))).(((((((.....))))))))(((.((((((((.((((.((.(.(((((((.(((((((....((....))..))))........)))..)))))))..).))..)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((.{{{{{|||(.((({(.,((((({.,{.{.{((((((((.......)))))))))}}})))))}..}}}.|,.((((({,{{.,..(((...)))...,.}}))))))((((((.((((((((((((.{,((....))..,}))}}})).)))))).)))))),.,,.{({(((....))))),)}.|||||}}|{{{{,.{{{{{((,(((((((((((((((..((..,,..{{{(((.{.,{.....).)))))}))..))))))...,))))))))),.|||{((((((((((...))).)))))))))),}|||||,,(((((((((({(((((((((((....))))).))))))(((((..(((((..((((....,((.{.......(((((({(((({,(((((((((((((.((((.(((((((..{(,(...,..{((((((((((.(((((.(((((......))))))))).).)).)))))))}.,..,}}.)),.))))))))))}..{({{.|.((((.(((((((.{(.,((((((......{(((....(((((((((.(((.{.(((((.{.((....(((.((((((((((.((((((((((((((((((,..{{{...,},|{(..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..)}))))))..))),)))))))))......,,..,.{{,{{{((({((({.,{{{{{.{{.,(((((.(((...(((((((((..(((...(((.(({{{{...,,..}||(({{{{{.|,.({(((((..,,({{{...{(|(.......|||}}}}}..,,))}}}))..}.))})))),..})).)))))).)))))).)))))).))))).,}}.,,,|||||||..........)}}})))||||||||,||}},.|||}}),}}|,,,}}})))))))))))))..))}.)))))......,(((((((..(((((.........)))))..)))))}),},..))).)))))))))....}))))))))).,.)).)))))))....((((((((((({{(((.{{{,...,}}}})))),{{,.....))...)))))))))))((((..,....,..))))....(((((((...(((.((({....,))).)))...))))))).)))).|.)))}({(....)))..((((((..((....)).))))))..((((((({.......,)))))))}))))).((((((((.{{{{{((((.,...((((..{(((...((((((.........))))))....))).}..))))..,}.))))))).)))))))){{{{..{{{{||,,,,,.}),)))))..))))....)),,))))))))).)..))))))..,}}.},...)))).)))))..)))))},}))))))))).,))}))))).,}))}},}}.)
Forensic Context

No forensic context available.