Basic Information
Symbol
hsa_PVT1_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085539
hsa_circPVT1_005
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
8:128867401-129082518
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127855155-128070272
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-450.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-475.33 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
282.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((.(((((((((((((((..((......((((((.(........).))))))))..))))))....)))))))))(.(((.((((((((((...))).)))))))))).)(((((..((((((((((.(((((((((((....))))).))))))(((((..(((((..((((....(((.........((((((((((((.((((((((((((((((((.(((((((..((.(.......((((((((((.(((((.(((((......))))))))).).)).))))))))......).))..)))))))))))...........(((((.......((((((.((......(((((((.((((((((((((((...(.(((((((((((((........))).)))))))))).)....)).))))))).((..(((..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..)))))...((((((..(........)..))))))((.(((..((((((..(((.((.((((.......)))).)).)))..))))))...))).))......)))))))))))).....(((.(((((...((((((((((.(.......((((.......(((((((.(((.(((((........))))).))).))).))))))))((.(((((..(.(((((..(((((((((((((((((....((((((((.....))))))))((.((((((.((.(((..(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..))))))).)).)))).((((..(....)..)))))))))...))).)).)))))).))))))))................)))))))..))))...))))).)..))))).)).((((..........))))....(((((((...(((.(((......))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).)))))).)).))))))......)))))...))))))).((((((((...(((((((.(...((((..((((...((((((.........))))))....))).)..))))...).))))))).))))))))((((..((((((.......).)))))..))))....)).)))))))))).)..))))))..)))......)))).)))))..)))))..))))))))))..)))))))).)))).).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.(((((((.(((((((((((((((..((..,,..{{{(((.{.,{.....).)))))}))..))))))...,))))))))){.(({{((((((((((...))).)))))))))).}(((((..(((((((((({(((((((((((....))))).))))))(((((..(((((..((((....,((.{.......(((((({(((({,(((((((((((((.((((.(((((((..{(,(...,..{((((((((((.(((((.(((((......))))))))).).)).)))))))}.,..,}}.)),.))))))))))}..{({{.|.((((.(((((((.{(.,((((((......{(((....(((((((((.(((.{.(((((.{.((....(((.((((((((((.((((((((((((((((((,..(((...,},|{(..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..)}))))))..))),)))))))))......,,..,.{{,{{{((({((({.,{{{{{.{{.,(((((.(((...(((((((((..(((...(((.(({{({...,,..}||(({{{{{.|,.({(((((..,,({{{...{({(.......|||}}}}}..,,))}}}))..).))})))),..})).)))))).)))))).)))))).))))).,}}.,,,|||||||..........)}}})))||||||||,||}},.|||}}},}}|,,,}}})))))))))))))..))}.)))))......,(((((((..(((((.........)))))..)))))}),},..))).)))))))))....}))))))))).,.)).)))))))....((((((((((({{(((.{{{,...,}}}})))),{(,.....))...)))))))))))((((..,....,..))))....(((((((...(((.((({....,))).)))...))))))).)))).|.)))}({(....)))..((((((..((....)).))))))..((((((({.......,)))))))}))))).((((((((.{{{{{((((.,...((((..{(((...((((((.........))))))....))).}..))))..,}.))))))).)))))))){{{{..{(({{|,,,,..}),)))))..))))....)),,))))))))).)..))))))..,)).},...)))).)))))..)))))},})))))))))..))))))))},))).|....,
Forensic Context
No forensic context available.