Basic Information

Symbol
hsa_PVT1_0001800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085542 hsa_circPVT1_007
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
8:128902835-128996450 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127890589-127984204 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-307.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -321.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.........)))(((((((.............(((.((.(((((.((((((.(((((((..((.((((((((.....))))....)))).)))))))))...)))))).))))).)).)))(((((((....((((((((((((..((((((((((((...(......)...))))))))..........(((.(((..(((((((((((((((...(.(((((((((((((........))).)))))))))).)....)).))))))).((..(((..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..)))))...((((((..(........)..)))))).....))))))...))).)))....)))).)))))).)))))).((((((.......))))))......)))))))..)))))).(((.(((((...((((((((((.(.......((((.......(((((((.(((.(((((........))))).))).))).))))))))((.(((((..(.(((((..(((((((((((((((((....((((((((.....))))))))((.((((((.((.(((..(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..))))))).)).)))).((((..(....)..)))))))))...))).)).)))))).))))))))................)))))))..))))...))))).)..))))).)).((((..........))))....(((((((...(((.(((......))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.........)))({(((((...,,.....,.,{((.{(.(((((.((((((.((((((({({(,,(((({{{,....}}}}..,}}})}})}|))))))...)))))).))))).)).)}|(((((((.,..((((((((((((..(((({((({{((...{.,,,,.|,,.|}||||||,...|,...,|}|{{{{{,(((((((((((((((...{.(((((((((((((........))).)))))))))).}....)).))))))).((..{((..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..))))),|.((((((,,{........}..)))))).,,..}})))}||}),}})}}},..)))).)))))).)))))).((((((.,.....))))))......)))))))}.))}})).(((.(((((,..{((((({(((,(.......((({,,.,.,.|||{{{{.(((.(((((.,,...,,))))).))).})),}}}}})))((.(((((..{.(((((..(((({((((((((((((....((((((((.....)))))))){{.((((((.((.((({.(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..)))))}),)).)))).((((..{....)..))))))))).}})}).)).)))))).})))))))...,............)))))))..))))...))))).}..))))).)).((((..,....,..))))....(((((((...(((.((({....,))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).))))))..)
Forensic Context

No forensic context available.