Basic Information
Symbol
hsa_PVT1_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0085548
hsa_circPVT1_013
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:128951754-129108900
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127939508-128096654
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-280.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-294.29 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
134.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((........(((((((((....(((.(((((...((((((((((.(.......((((.......(((((((.(((.(((((........))))).))).))).))))))))((.(((((..(.(((((..(((((((((((((((((....((((((((.....))))))))((.((((((.((.(((..(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..))))))).)).)))).((((..(....)..)))))))))...))).)).)))))).))))))))................)))))))..))))...))))).)..))))).)).((((..........))))....(((((((...(((.(((......))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).))))))(((....)))........((((((((((((.(((((...))))).....((..(((.(((((....))))).)))..)).......((((((.((((((...((((((((((((..((((((((...........))))))))))))))))).))).....)).)))).))))))...(((.......)))...)))).))))))))...(((((..((((((.((((..........)))).)))))))))))......))))).)))).......((((((.((....))......(((((....)))))((((((.((..(((((((((.((.(........))).)))))..))))..))))))))))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((........(((((((((....(((.(((((...((((((((((.(.......((((.......(((((((.(((.(((((.,,...,,))))).))).))).))))))))((.(((((..{.(((((..(((({((((((((((((....((((((((.....)))))))){{.((((((.((.((((.(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..)))))}),)).)))).((((..{....)..))))))))).)})}).)).)))))).})))))))...,............)))))))..))))...))))).}..))))).)).((((..,....,..))))....(((((((...(((.((({....,))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).))))))(((....)))........((((((((((((.(((({...})))}.....((..(((.(((((....))))).)))..))......,((((((.((((((...{(({((((((({..((((((((...........))))))))))))))))}.))).....))}}))).)))))).,.{{{.......})}...)))).)))))))),..(((((..((((((.(((({({...})},)))).)))))))))))......)))))}}})).......((((((,((,,{.{|.,,...{,,||..,.))))){(((((.((..(((((((((.{{.(........}}}.)))))..))))..))))))))))))))))))...
Forensic Context
No forensic context available.