Basic Information

Symbol
hsa_chr8_0114300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PVT1_0028
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
8:128868735-128869298 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127856489-127857052 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-272.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -280.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 64.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(..((((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((((((.(((((.(((.((((((((((.(((.(((((..(((....)))..))))).............((((.(((.....(((.((((...)))).)))))).)))).(((((((((((((((..(((....((((.(((...)))))))))))))))))).)))))))........(((((((...((((((.......................((((((((((...(((((((.........)))))))..))))))))))................(((((.((.....)).)))))......))))))...)))))))))))))))))))).))).))))).))))))))).)))))))))))).))))))))))))).))))..).))))))))))))))))))))))))))).))))))))).))))))(.(((.((((.......................)))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(..((((.(((((((((((((.((((((((((((.(((((((((.(((((.(((.((((((((((.{((.(((((..(((....)))..))))},,...........((((.(({....,(((.((({...}))).)))))).)))).(((((((((((((({{,{((....((({,((,...,))))))))))))))))),}))))))..,,.,..(((((((...((((((..............{{{{{,{{.,,,|||||||},.(((((((.........)))))))..||,,,,,))}.................,||,.||........,},........))))))...)))))))))))))))))))).))).))))).))))))))).)))))))))))).))))))))))))).))))..).))))))))))))))))))))))))))).))))))))).))))))(.(((.(((({.....,,......,,..,..,.)))).))).)
Forensic Context

No forensic context available.