Basic Information

Symbol
hsa_PVT1_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PVT1_0024
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
8:128949535-128951922 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127937289-127939676 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-851.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -896.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((.(((((((((((((.((....)))).)))))))..))))))))...((((.((((.....)))).)))).((((((((.......((((....))))((((((((((...(((((.(((((...........)))))(((((((((((..((((....((((((((((........))))))))))...(((...))).....(((((((((......))))))))).........(((......)))...(((((................................((((((((.(.(((.((((.((((((.(((...))).)))))).(((((((((((((((..((((((((((...(((...((((.......))))....)))((((((......)).)))).((((((.....))))))......))))))))))..)))))((((.((((....)))).))))((((...(((..((((.......))))....)))...)))))))))))))).(((((((((((...........(((((((...((((((((.((((........))))...(((....)))(((((((((.....))).))))))..........((((((((((((..(((((..(((((..((.((((.(....).)))).))....(((((((((.(((((((..(((((((((((..........))))))).........((((((........)))))).((((..(((.((((..((((((..(((...((((.(((.((((((.....))))))..)))...)))).......((((((((.....(((.(((..((((((......))))))..))).)))))))))))......(((((((......))))))))))...))))))..))))))).)))).......))))((((((...)))))).(((((((((((((.(((((((((((...((((((((((.((((...((((((((..(((..(((.................)))..))).))))))))..)))).((((((((.....)))))))).)).))))))))..)))))))((((.....)))).(((((((.......((((..((((((((((((((((((((.((..((.......))..))))))).)))((((((((((((((..(((((((((((((.((....)).)))).))))).........))))..))))...(((((((((.((((((((((...))))))......((((((.((((((((((...........)))).)))))).))))))(((..((((....))))...)))..((((((((((((((.(((((.((((((.(((.((.((.......)).))..))).)))))).))))).)).))))))....)))..)))...)))).)))))))))....))))))))))((((((((((((.(((.....(((.((..((((((.....)))))))).)))....))).))).)))))))))....)))..)))))))))))))))))))))))).)))))).)))))))......(((((...)))))........)))))))))))))))))))))..)))))..)))....(((.(((((((((...))).)))))))))..........)))))))))..))))))))))))))).........)))))))))))....(((((....))))))))).))).).))))))))(((((..((((((....((......))....))))))..)))))))))))))))))))))..))))...(((((((((......((((.....((((((((.((((((...((((((.........((((((.((.((.((......)))).))..)))))))))))).......))))))...))))))))......)))).....)))))))))........((((...((((..(((((...((((((((((((.(((.((((..(((((((.((((((((.((.(((.(.(((((((.(((((((..((((((........))))))....))))))..).))))))).).))).).).))))))..)).)..))))))..)))).........(((....)))))))))))))..)))))..))))))))).....)))).)))))....)))))))))).(((((....))))).........))))))))..)(.(((((.....(((((((.......))))))).((((((((((..............))))))))))....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.((((.(((((((((((((.(,....}))).)))))))..))))))))...((((.((((.....)))).)))}.((((((((.,,,,..((((....))))((((((((((...(((((.(({{{...........}}}}}(((((((((((..(((({...((((((((((........))))))))))...({(...}}}.,{,.(((((((((......))))))))}..,......(((......)))...,{{{{..............................,{(((((({(.({(,(,(({{,((((((.(({...})).)))))).(((((((((((((((..((((((((((..{{((((,((({.......}))).....}}|||(((({.....)}}))).|(((((.....))))))...,,.))))))))))..))))}((((.((((....)))).))))((((...{((.,,,,........,))}..,.))}...)))))))))))))).(((((((((({...........(((((((...((((((((.((((........))))...{{{,..,||.(((((((((,...,))).)))))).,||,.....||||{((((((({.(,((({{({{,(,,(((,,,,.,}}}}},},))}))}...(((((({{{((((((((.,({{{((((((({,........))))))).,,..,,,,({{(((,,...,,.)))))).|,{{,,(({,((((..{{((({..(((...(((((((,{....}}.)))))))....)))..{{(({({{.,,.....,,}})))),}}},{|(({{((((((.,....)))))}..}))))))))..,}}}.}}},|(((((((......)))))))||{,,,,||}||,.}}}}))),}},}....,}})}))((((({...}))))).(((((((((((((.(((((((((((...((((((((((.((((...((((((((..(((..(((....{.,..........)))..))).))))))))..)))).((((((((.....)))))))).)).))))))))..))))))}({((,....)))).(((((((.......,,{(,.((((((((((((((((((((.((..((.......))..)))))))},)),(((((((((((((..(((((((((((((.{{....,}.))))}}}))).........))))..))))...(((((((({.(({(((((((...)))))}}}..,.((((((.((((((((((...........))))))})))),)))))}{((..((((....))))...))}..,.,,{,((((((((.(((((.((((((.({{.((.((.......)).)},.})).)))))).))))).)),})))))....}},..|||...,})),)))))))))....)))))))))|((((((((((({.(((.,...{({,{{|,{{((((,,...,)))))},.))),,..))).))).))))))))),...)))..)))))))))})))))))))))))),)})))).)))))))...,,.(((({...}))))........)))))))))))))))),,||{{{{{{{|..,,,....(((.(((((({({...,}).)))))))))}},,}}}}}}))})))))),,))))))))))))))).........)))))))))))....{((((....))))))))).))),).))))))))(((((..((((((....,,......}}....))))))..))))))))}))))))))))))..))))...(((((((((......((((.....((((((((.{{{{{{...((((((...,,,...{{(({({(({,,.{|,,,,..})},.,}.,))}}}}))))))...,,,.}}}}}),,.))))))))......)))).....))))))))).......,({({...((((..(((((...((((((((((({,(((.((((..(((((((,{({(((((.((.(((.(.(((((((.{((((((..((((((........))))))....))))))..}.))))))).).))).).).)))))}..)).)}.})))))..)))).........(((....)))))))))))))..)))))..)))))))))...,,)))).)))))....)))))))))).(((((....))))),}},.....))))))))..,,.{((((.....(((((((.......))))))).(((((((({(,.........}...))))))))))....))))))
Forensic Context

No forensic context available.