Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0000700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0073826 hsa_circRAPGEF6_045 hsa-RAPGEF6_0058
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130764595-130769351 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131428902-131433658 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-304.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -324.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 250.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)((((.((((((((((.......((((...(((((((.(((((.(((((.((((((((.....)))))))).....(..((((.(((.....))).))))..)..((((.(((..((....))..)))...)))).........)))))))))).)))..))))..))))((((((.((((((((((((((.(.(((.(((((.(((((..(((..(((((((....(((((((.(((((((((..((((.(((((.((.....(((((((...(((..(((....))).....)))....)))))))))))))))))).))))..))).)).))).)))))))))))..)))...))))).(((((((...((((.((((((..........((((....((((........))))....)))))))))).)........)))))))))).......))))).))).)))))))))))......)))))))))).(((((...((((((((......((((((..(((((...((((((..(((.(((((((((((((.((((.....((..(((.....)))..)))))).)))))))..)))))))))....))))))...)).)))..))))))...((....))....))))).))))))))......((((.(((...)))))))...(((..(((..(((((.(((((((.(.((......)).)))).)))).....(((((....)))))..(((....)))....(((((.(((((((((.....)))))))))...))))).)))))..)))..))).)))))).))))((((((((..((((((.....(((...)))....))))))....))))))))..(((((.((.........((((..(((.((.(((.((........)).))).)))))...))))....(((((((..((.((((((((......)).)))).)).)).))))))))).))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.............)((((.((({((((({{{....{(,(({....}}}.}}.,||,}|}}||.{({{{(((,....}}}}}}||,...{({{((((,{{{{,{,,|||,}|||..,..{{(({{,..{((,{,.|{,.,,|||||||}...|||||}}......)})}))),.}))}...}})||||||.||{{((((((((((.(.(((.(((((.(((((..(((..(((((((....(((((((.((((({(({,.(((({((((({,({.,..{{{(((({,.{(,..({,....))),,,.,},}.,,.},,,,)),)))))))))).)))}..)))},).))).)))))))))))..)))...))))).(((((((...(((..{{{{{{.{{{,,....((((....((((........)))).,..)))))))))}.}........)))))))))).......))))).))).))))))))))).,,,..}}|||||||,.,,,,....|||||||,....}}{(((((..(((((...((((((..{({{(((((((((((((.((((.....((..(((.....)))..)))))).)))))))..}))))))})....))))))...)).)))..))))))||.||,,.,}}.|,|}}}}|.}}||||||...,,}|||{{((.{{{{||,|,,...,),))))))..}||{||{|{({{.{{((......),.)),.}}|||||,,.(((((....)))))..(((....)))....(((((.(((((((((.....)))))))))...))))).....}}},......,.}}}}}}.,,|,((((((((..((((((.....(((...)))....))))))....))))))))..(((,{,.,.}},,}}..(((({.((,,((.(((.((.,...,..)).))).))))).,.))))....(((((((..((.((((((((,...,,)),}})).)).)).))))))),}.,,))).))))
Forensic Context

No forensic context available.