Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0007500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0127880 hsa_circRAPGEF6_035 hsa-RAPGEF6_0034
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130788747-130808437 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131453054-131472744 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-256.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -280.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 392.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((..........(((((..........)))))(((....((((.(((((.((.....)).))))).))))..)))(((((.........)))))...(((((((((.((((((((.((((.((((.((..(((((.....)))))..)))))).)))).................(((((((((......((.(((((((((......(((((..((((((.((..((((.(((.....(((((....((((.....))))..)))))........((.((((((.(((.....)))............((((.((((((((((((((.((....)).)).....))))))...))))))))))..((((((.((...((((((.......(((.(((((((((((......)))...........((....))....(((((.((((...(((......))).))))....)))))..(((((((.......))))..))).....)))))))).))).....))))))....)).))))))(((((((((((((...........(((.((....)))))..(((((((((((((....((((......))))......)))))))))))))(((((.((......(((.(((.....))).))))))))))...........))))))))))))).)))))).)).............(((.(((....))).))).))).))))..)).))))))..)))))....))))).)))).))......)))))))))....)))...)))))..))).)))).))..(((((.........))))).......((((....))))...((.((((((((.(((((((((((((........))))....)).)))))))..)))).))))))..........)))))).))))(((.............((((..((((.((....(((((((.......)))))))....((((((..((......))..))))))((((((((.(((((((((....((....))...)))))))))...)))))))).....(((((......))))))).)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,,,(((....|||,|}}}(...,(((((((,,.{{(({{....((((.(((((.((.....)).))))).))))..,}}|((((.........))))|,{{,.,,|{,...||||{{{,,,{...,,|,..({((((....)))))).(((,((((((.((((((((({..{{{{(({{,.,{.{{....},.,,.,,..}}.}))),{(({....))))...........})))))))}.).)))))).}}){{,,,{{{|{{,|||||}||||||{,,,||||||,..{((.....)))...,...,,,,,((((.(((((((((((((({(,...}))}}}.....}))))),..}))))))))|,{((((,,.,,....|||||},.,...|||.||{,,||||{{,,..,,|||.........,,{{,,..,,.,,,||{{{,|{{|.,,||||.,.,|}}}.}})),|,|}..||,.{({{{{|}.,,,..))))|,}||||||.,}}}}))),))}},,}.}}))))}},.|||||},,,{((((((((((((,...,{{,,..{,,.{{.,..},})}..{((((((((((((....((((......))))......))))))))))))|(((((.{{.....,(((.(((,...,))).))))))))))}.....,,...})))))))))))},||,....{{((({{........(((.(({....))).))).))))))}||{||||}}||,,,..,},,...{((((((|.(({.....{{((.{.(((({({((({.((((.{{...,.}))))}||,.(((((......,..)))))....,.,{{{,..,,|}||{.{(({,,,{{{{{...||||},,|,||}}.,,...}))}....}},},}},,,{{{(({{||..{({{{({.{{{,|||,||,.,,..,..,,,,,,...,,.((({,.,.,,,,,.,},||{{(((,,.....|||},,}..,,|,,|||,}|,))},..))}.))))))},.|,|}}}}}||((((({...,|}}}}),}))),),,))))}}.).)))).))).,))))))}...,,}},}},}})))}}))},,)
Forensic Context

No forensic context available.