Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0010000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0127887 hsa_circRAPGEF6_019 hsa-RAPGEF6_0082
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130797398-130883883 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131461705-131548190 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-642.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -698.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 746.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(........((.(((......))).))..(((.(((.(((.(((.......(((((......)))))........(((....(((((((..(((((((((((((((((((((..((((((...((((((((((((((.((.(((((((...))))).)).))............(((((((((.(((...))).)))((((((.(((.(((..(((((((....((((.....))))((((....))))..(((((....))))))))))))))).)))..))))))...((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).)))))).))))))))))))..))...)))))).....(((((((((((((((((.(.((((.(((((((...))))))).)))).).)))..........((((....))))........(((((.((....)).))))).)))))).((((((.((((....)))).))))))..(((((((((.........(((((...((.(((((((((((((((...(((.....(((...)))..)))...))))))..(((((((.((((......))))..))))))).........(((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..((((((((.(((...(((((((............)))))))((((.(((((((....(((.............((..((.(((((((((((.............((((.......(((((.....(((((((.(((.((............(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((((((.((.....))))).....))))))))..................))).)).))).))).))))..((((((....)))))).......)).)))))))))).....))))).......))))..............)))))))))))))..)))))....))))))).))))...((((((.(((((...)))))))))))..(((((((((..((.((((((((..............((((((((...............))))))))..............)))))))).)))))))))))...))).))))))))..(((((....(((((((((....(((((..((((((......(((....)))........))))))..(((((((((((...((((((..((((((.........((((((...((((((((((....)))))..))))).((((.((...))..))))...((((..(((((((.....................))))))).....))))........(((((((((.......((((.(((.....)))))))(((...(((((.((((((....(((.((....))))))))))).)))))...))))))))))))))))))....((((((.........)))))).((((..((((((.(((.(((((..(((((((((((..(....(((..((((.((........................)).))))..))).......(((((((.....))))))).........)..)))))))))))(((((((..(((....)))..)))))))....((..(((....)))....)).((((....)))))))))))).)).))))..))))...)))))).))))))....))))))).))))))))))))).)))))...)))))((((.((((.((..(((((.....)))))..)))))).))))))))))))).))...))))).......)))))))))..))))))))((((....)))).)).)))))))))))).......(((((....((((.....))))..))))).........)))))))..(((.....)))............((((.((((((((((((((.((....)).)).....))))))...))))))))))...)))))))....))).(((......)))......))).))).))).))).......(((((((((...(((..(((((((((.(((((((.(.((((...((.((((..((...((((.((.....(((((.....)))))......)).))))...))))))))...)))).).))))(((((((((((...........(((.((....)))))..(((((((((((((....((((......))))......)))))))))))))(((((.((......(((.(((.....))).))))))))))...........)))))))))))..........(((((((........(((.(((....))).))).))))))))))..)))))))))...)))..)))))))))...........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,.,,,|}}{........,{.({,..,,.,))}.},..{{{.{||||||||({,......(((((,....,)))))........{{,....(((((((..(((((((((((((((((((((..((((((,..{(((((((((((((..{,,,(((({...})))}||{{{{,..,,,......((((({,(({((({,.,.|,|||(((((({(((.,(({{(,{,,,,...}}}||,}}},|}))||||.,,,}}}}|||||{{..{{|||,,|||,},.,,)}),,}}))))}}}},||{{.{{{{{{.(((({.....})))).)))))).)))).)))))}.)))))))))))),.,|,.,||}}||.,,,,(((({{((((..((((,.|.{(({.|((((({...))))))}.}))).,.(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.,(((({{({{.,{,{({,..||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...(((,|{,|{,,...,))}})))...)))))).))),,,||,||||......,}},.}})),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..))}).}})))))})}}}}))})))}......,}.}})}))))))))))))))))))..)))).))}...,,.,{{({{{{((({.,,{,.(((((..........))))).,}||{,,||..{{{({,,..,{{{{,{({{,,,,,,((.{(((......,,}|||{{{(,,.((|.,,..||,..(((((((({{.{{(.....))))).....))))))))...,,.......,,.{,{|||{},,|}|{||||{||,..{(((((....}))))),,{{({.{((((,...}}}}).}})}|||,,|||.||}|||}||,,||,,,,}}})))}}}}{((((((((((((.(((.{,{.|((({{....{{{{{{.{{{{,..{{||||}||}}}..{{((({{{{|.,{.{(((((((...,..,....,.,{(((((((.....,.........)))))))).......,,,|...))))))))}}))))))))}}..})))))|||{|{...(((((..{.(((((((((....(((((..((((((......{((....}}),.......))))))..(((((((((((...((((((..((((((.,,,.,,..((((((,,.((((((((({..,,))))}..||||}.(({{,,,,{{{{,.|||,,,,{(((..(((((((.......,,,,..........))))))).....)))},.......(((({{{{,...,,,,{(((.(((.....))))))}{{(,,,(((((,{{{{{|,,,||||.||,,,,)),,))))))},||}},.},)))))))))))})))))),,,.((((((.........)))))).((((..((((((.(((.(((((..(((((((((((......,({(..{{{{.{{....,.............,.....)).))))..|||.......(((((((.....))))))).......,,}..)))))))))))(((((((..(((....)))..))))))).....,...{((({,,,|,....},))})),...,..)))))))).)).))))..))))...)))))).))))))....))))))).))))))))))))).)))))...)))))..,,.)}}}}}{,((((....)))))))))).))))))))))))}.......)))}),,}},}.}}...}}}}))))).,,})))))){(({....)))).)}.,))))))))))).......(((((...,(((,...}}))}|..))))).,.,,....)))))))..(((.....)))............((((.(((((((((((((({(,...})),)}.....)))))),..))))))))))...)))))))....}}}.|||}....,}|,.,},..})},|}},}}}.))).......(((((((((...(({..(((((((((.(((((((.{,({{{...,,,((({..((...((((,({.....{|||{,..,,|||}}.,||,})).)))}...)}))))}}}..))}},|.,,{((((((((((((,...,{{,,..,,,.{{.,..,,))}..{((((((((((((....((((......))))......))))))))))))|(((((.{{.....,(((.(((,...,))).))))))))))}.....,,.,.})))))))))))},||.....{{{{{,{........{{{.{{{....}}}.})),))))))}}})..)))))))))...})}..)))))))))...........)
Forensic Context

No forensic context available.