Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0011600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0127888 hsa_circRAPGEF6_018
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130808280-130883883 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131472587-131548190 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-490.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -529.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 605.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((............(((.......)))...........))))))))(.((.....(((((......)))))...............((......))....(((((((((....((((((.........(((((((((((((.((.(((((((...))))).)).))............(((((((((.(((...))).)))((((((.(((.(((..(((((((....((((.....))))((((....))))..(((((....))))))))))))))).)))..))))))...((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).)))))).)))))))))))))((((.(((..(((((((((((..((((....)))))))).))))))).))).)))).........((((((((((....((.(.(((...(((..(((.(((.((((((........))))))..))).)))))).))).).))))))))).)))......))))))))))))))).........(((((((.((..((.((((..((((...(((..((((((((..((((.((((.(((.(.(((((((((....(((((((.......)))).(((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...))))))).....((((((((.((((.(((((((..(((((((((((((........))))))))(((((((..(((((((((((((..((((((((((((.............((((.......(((((.....(((((((.(((.((............(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((((((.((.....))))).....))))))))..................))).)).))).))).))))..((((((....)))))).......)).)))))))))).....))))).......))))..............))))))))))))((.((.((((.....)))).))...))((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))))))..)).......)))))(((((...(((((((...............)))))))((((((((((((..(((((.((((((.(((.........((((.........))))))).))))))((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))((((.((..((......))..))))))....((((..(((((((.....................))))))).....))))........((((........)))).....(((.....)))..))))).))))))))))))....)))))....)))))..))).)))).((((...(((((.................((((((.........))))))))))))))).))))))))))))...(((((((((((..(....(((..((((.((........................)).))))..))).......(((((((.....))))))).........)..)))))))))))(((((((..(((....)))..)))))))....)))......)))))))))((.((((....)))).))......).))))))).))))....)))))))).(((((.........))))))))...)))))))).)).)))))))))......((((((....))))))...)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({.{{{|||{........{{,({......|}}}......,,..}}||||||(,{{,{{{.(((((,....,)))))........,.....,|{,,(((....((((.((((.......)))).))))....))}.((((((((((((.({{,(((({..,,}}}|,{(((({.{,,,....,,((((({,(({((({,.,.|,|||(((((({(((.,(({{(,{,,,,...}||||,}}},||))||||.,,,}}}}||((|{{..{{|||,,|||,},.,,)})},}}))))}}}},||{{.{{{{{{.((({{,,...}}})).)))})),)))).))))),,}..,.))})))),,,{{,{{{.,(({{{{{||||..((((..,,||},}}||||}|||||,|,,.))))}},.,}},...(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.{(((({(({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...(((,|{,|{,,...,)))})))...)))))).))),,,,},||||......,}},.}})),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..)))).}})))))})})}}))})))}......,}.},)}))))))))))))))))))..,}||,}}||,,{{,||{{.,.{{{{{.,,({.{{{|{.........,))))}..})},.)))))))))))).|}}|||.||||,..,,,{{,,(((........}}|(((((((.(((.((..(((..(((((((({{.{((,....}}}}}...,.))))))))...,,....,.,.....,))}.)).))).)))},}}}..((((({....))))))..,{{{.{((({..,,))))}.}}}|||||{|{,.|{||||,{{{{{{{{{....))))))},,}}}|,.{{.||{|...,.}})),)).,.,,{{{{{{.{{{{,..{|||},}}}}}},,|||||||||},}|.,{||{|||,,.,..}},,}}}}|{||||||,,,.,,,........))))}})},.....,{{{|,..}}))))))}}})))}},,,,.,}}}))}|{{{{{...(((((..{.(((((((((....(((((..((((((......(((....}}),.......))))))..(((((((((((...((((((..((((((.,,,,,,..((((((,,.(((((((((,..,,))))}..||||}.(({{,,,,{({{,.|||,,,,{(((..(((((((.......,,,,..........))))))).....)))},.......(((({{{{,...,,,,{(((.(((.....))))))}{{(.,,(((((,{{{{{|,,,||||.||,,,,)),,))))))},||}},.},))))))))))),)))))),,,.((((((.........)))))).((((..((((((.(((.(((((..(((((((((((......,({(..{{{{.{{....,.............,.....)).))))..|||.......(((((((.....))))))).......,,}..)))))))))))(((((((..(((....)))..))))))).....,...{({({,,,|,....},})}))}...,..)))))))).)).))))..))))...)))))).))))))....))))))).))))))))))))).))))).,.))))).....)))))}{(((((....)))))).}}}},)
Forensic Context

No forensic context available.