Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0013100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0127889 hsa_circRAPGEF6_022 hsa-RAPGEF6_0022
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
5:130815202-130883879 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131479509-131548186 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-433.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -467.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((............(((.......)))...........))))(((((........(((((......)))))........(((((((.((.(((....((((.((((.......)))).))))....)))((((((((((((.((.(((((((...))))).)).))............(((((((((.(((...))).)))((((((.(((.(((..(((((((....((((.....))))((((....))))..(((((....))))))))))))))).)))..))))))...((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).)))))).)))))))))))).((((.(((..(((((((((((..((((....)))))))).))))))).))).)))).........((((((((((....((.(.(((...(((..(((.(((.((((((........))))))..))).)))))).))).).))))))))).)))......((((((.((.(............).))))))))((((((...(((.....(((...)))..)))...))))))..(((((((.((((......))))..)))))))...((((...(((....)))....))))....)).))))))).(((((((((((((.(((((.((.((((((((.....((((((((.((((.(((((((..(((((((((((((........))))))))(((((((..(((((((((((((..((((((((((((.............((((.......(((((.....(((((((.(((.((............(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((((((.((.....))))).....))))))))..................))).)).))).))).))))..((((((....)))))).......)).)))))))))).....))))).......))))..............))))))))))))((.((.((((.....)))).))...))((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))))))..)).......)))))(((((...(((((((...............)))))))((((((((((((..(((((.((((((.(((.........((((.........))))))).))))))((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))((((.((..((......))..))))))....((((..(((((((.....................))))))).....))))........((((........)))).....(((.....)))..))))).))))))))))))....)))))....)))))..))).)))).((((...(((((.................((((((.........))))))))))))))).))))))))))))(((......))).......))).)).)))...)).)))))..........((((((((((..((..(((.......(((((((.....))))))).......)))))..)))))).)))).))))))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{(,,,........,{.({{.....|))|.,.....,..}}||(((((.,......(((((,....,)))))...............{{{,.{{.,,.,,{(,((({....,..)}||.||}|{((({.|.((((((((((((.((({(((((.,,,}}}|,((((({.{,,,....,,((((({,(({((({,.,.|,|||(((((({(((.,(({{(,{,,,,...}||||,}}},||))||||.,,,}}}}||((|{{..{{|||,,|||,},.,,)}),,}}))))}}}},||{|.{{{{{{.((({{,,...}}})),)))})),)))).))))),,,....)),}}}),{{{{,{{{..(({{{{{((({..((((..,,||}}}}||||}|||||,|},.)))),,..,,,,...(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,(,((((,,{{(,,,((({.,(((({{({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...(((,|{,|{,,...,)))})))...)))))).))),,,,,.||||......,}}}.}))),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({({{(((.....))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..})}).}})))))})}}}}))})))}......,}.},)}))))))))))))))))))..}}|},)}||,.,,.,|{|.,.|{|{{.,,(,.{{{||.........,)))))..))}..)))))))))))).,}))))}(((((((((.....(((,,....,,|||(((((((.(((.((..(((..(((((((({{,{((.....)})}}.....))))))))...,,....,,,......))).)).))).)))},)}}..((((((....))))))..,(({.(((({....})))).}})|((((((((.((((((.((({(((({....}))))||,,||||,.{(.((({.....}})).)},,.,.{{,|{{,{{{,.,,{{||....||}}||..}})))}}}}}}.,,|,.}})},....})})))))).)))))))),.,||.....,.,}|||,,}|,,....{(((({.,,,|}}||||||}||,.........((((.{{{.{{{.}||||,,,|},,,}|{||||.|||{}|}..||||.,,}},((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))...,,,,|}},..,},)))).}}}}}|(((((...)))))}|.||||{|{,,{{...{((((({{,,..,,{(((..(((((((.....................))))))).....)))},,..,,,.(((((({{,...,,,.,(((.(((.....))))))|{{{.,,(((({,{{{{{{..,|{{|.||,,.,})}}))))))},|}}}}.,.)}})})))}}}}.,,},,,,..||((((.........)))))))))))))),.))),}))))))))).{{((({((({{......|{,|.,||{,.,{,,.{{,,..........,,...,,|||}}}}..|||.......(((((((.....))))))).......}}),.}}))))))))))))))),....,.,,,.))))}
Forensic Context

No forensic context available.