ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_RAPGEF6_0020500
Basic Information
Symbol
hsa_RAPGEF6_0020500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0073833
hsa_circRAPGEF6_013
hsa-RAPGEF6_0049
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130857083-130897740
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131521390-131562047
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-82.80
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-89.90
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
65.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((((((((((((((.((((((.(((((...(((((((((((.(((.......(((((......(((.(((((.....)))))..)))..)))))......((((......)))).....))).))))))))(((((......)))))...............((......)).((((.((((.......)))).)))).)))....))))).)))))))))))..))))))))))(........((((((((..(((((....)))))....(((..(((((((.....(((((.........))))).....)))))))..))))))).))))..........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((((((((((({{{((((((.(((((,,.{{{((((((((.(({...,,..(((((......,{{.(((((.....)))))...,,..)))))......{{|{......}},,.,}}.))).))))))))(((((,....,)))))...............{{..,,,.,,.((((.((((.......)))).)))).}}},)}.))))).)))))))))))..))))))))))(........(((({{({..(((((....))))}....(((..((((((({{{..(((((.........))))),})},}))))))..))))))).))))..........)
Forensic Context
No forensic context available.