Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0021400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0127902 hsa_circRAPGEF6_011 hsa-RAPGEF6_0087
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
5:130883740-130899640 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131548047-131563947 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-497.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -541.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 646.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((........)))..(((((...(((((((((((((((((((((((((.....)).)))))))))....)))))..)))))......))))...))))).....(((((....))))).(((..(((((((((.((((((.((((((((((((((((((.....(((((((...((((((((....))))))))...))))))).))))))..(((((..((((((((.(((.(((((((((((.......)))).....((((((((((((((((((((((((((((......))))))))(((((((((....)))))))))....(((((........(((((((.(((((((.(((((.(((((((..(((....)))..)).))))).))))).)((((((((((((.(((((.(((..((((((...(((((.(((((((((((.((......))))))))))))))))))...)))))).)))................((((((((((.((((..((((((..((((((........................))))))..((((((.........)))))).(((((((((...........)))))))))))))))..)))).)))))))))).........(((((((.....)))))))....(((((((.(((((((...((((..((.(((((...........))))).)).....))))...))))))).((((((((...(((((.((((.((.((((((((..((((....((..((((..(((......)))..)))).))))))...)))))))).))..)))))))))...)).)))))))))))))(((((((((........)))))))))...(((((.(((........)))))))))))))...))))))))))))....((((((.....((.((((....)))).))..))))))........(((((.....)))))..(((((((((((............))))))).)))).................(((((...........(((((((.((........)).))))))).))))))))))).)))))))..((((((((...(((.((....))))).............))))))))..(((...........)))......(((..((...))..)))....)))))...........((.(((((.......(((((((((((((.(((((((..((((......(((((.......))))).....)))).....)))))))...))........))))))))))).......))))).))(((((((...((((...((((.((((((...((((((........))))))....)))))).)))).)))))))))))))))..)))))))))))))))).))))))).))))))..)))))......)))))..........((((((.......)))))).)))))...)))))))..))))))....((.((((.....)))).)).)))))))))...)))..((..(((..(((((.......))))).)))...)).(((.(((((((((.(((((((((((..(((((..(((((((((((((.....)))))))((.(((..((((....))))..))).))(((((.(((.(((((((((((........(((((.....)))))............(((((((..(((((........))))).)))))))...))))))))))).))).))))).(((((((((((((.((((((((.....))))))))(((...((((.((((((.(.....).)))))).))))...)))...........))).)))))))))).....))))))..)))))..)))........(((((((((((.((((............(((.......)))...........)))))))))..))))))(((((......))))))))))))).))))))))).)))....((((.((((.......)))).)))).))((........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((........)))|.(((((...(((((((((((((((((((((((((.....)).)))))))))....)))))..)))))......))))...)))))..,,.{((((,,,,|||||{({{,,{|{{{,,,,,{{(((((((((((((({{,((({{|.||,.(((((((...((((((((....))))))))...))))))).|||||}..{{{|||,||{{{((({(((.{(((((,((({....{{.||||......,,,,{{{{,,,,{{|,,..((((((((......)))))))){((((((({....})))))))),,,.|||,,.,,,.||{({{{{||,||||{|{.(((((.(((((((..(((....)))..)).))))).))))),|((((((((((((.(((((.((({{((((((...(((((.((((((((((((((......))))))))))))))))))...)))))).,}},,....,.....,,..((((((((((.((((..((((((..((((((.{{{{.,,........,,}}}}..))))))..((((((,,....,,.)))))).(((((((((...........)))))))))))))))..)))).))))))))))..,,,,,..{{{||||,....}}}}}}}....{{{,,{,,,((((((,,,(((,.....,{{{{...,,,,,,,.}}}||,||.,,..,,}},,.})))))|,{{(((({|,..(((((.{{{,.{{.((((((((.,((((....({..((((..(((......)))..)))).}})}}),,.)))))))),}}..}}},))))),,})).)))),)))))||,(((((((((........))))))))).,,(((((.(((........)))))))))))))...))))))))))))},..{||||{.,,,,{{,((({....}))).}|,,}}}}}}........{{(({.....))))}.,{((((((((((.,..........))))))).))))......,,{{{{....})}}||.,.,|,||,,,(((((((.{{........)).)))))))......}}}}}}.)))))))},{{(((({,...(({{((....))))}...}}},......,}}|||||,,{{||}}|,,,....|||,,,,.,||{.,||,,,}},}))}.,}.}}},,}}|||,.....(({((..{,,,,,,(((((.(((((({(,((((.(({{{{....,,...,,,,.......}))))}}.}})),,)),..}))))))))))))}.)))))..,}}||{{{{{{{{..{||||.{((((((,.((((((((((.(((((((((((...((((((........))))))....)))))).))))}.))))}},))))),,,..,},|||||||||||,.|||||||{|||{||{{|,,,|.,,..{||,,,..{{{((..,,(((({..,,,,,,,,,}|{|||||{{,||,|||}..,}}))}..,,||},}}}.,,..)))))}}}},},.))))}|.))}..,}....}))))))})}}))))))..)}})}}}},..,,..(((((((((.(((((((({((..{({((..{((((({{{{{{{.....}}}}|||((..,,..,,|||||.||||..|,||||(({{{.,(({(((((((,,,..,,}||}}|||||,.,.,)))},,,,,,..{{,,.,,,||||,.{{|||........}||||,||}}}))},,})})}}}}}}},}}}.))}}},(((((((((((((.((((((((.....)))))))),((.,,((((.,(((((,(,....,.,},,,,,)))),,,}}).,}}},...,,)))))))))))))),.,,,))))))..)))))..))),.,.....{((({((((((.((((,,,........|{,{||.....}))}......,,..))))))))),.})))))(((((,....,))))))))))))).))))))))),}))}}}.||||,|,{,.}}}}},)))).)))}..,,}}},})}},,}
Forensic Context

No forensic context available.