Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0224
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130766552-130788870 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131430859-131453177 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-411.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -437.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 296.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......))((((((.((((((((.(((((((...((((((((.(((((((((....((....))...)))))))))...)))))))).....(((((......))))).(.((((......)))).)...(((((((.....(((((((.((..(((((((.(((((...((..(((((.....)))))..))...)))))...........((((....((((....))))....)))).....(((((((((((.((((.....)))).((((((...........))))))..(((((.(((((.((((.((..(((.....)))..))..)))).))))).))))).))).)))))))).)))))))..)).......(.((((.....((((.........))))....))))).((((..((.....((((((((...((..((.((((((.(((((.((.........)))))))...)).)))).))))))))))))...))..))))(((.((.....)).))).............(((((((((..(((((((((...(((((((((((((((.....((((.(.((((((((((((((.((.(((((((........))))))))).))...................(((...........)))....(((.....))))))).)))))))).).)))).....))))).))))).))))).(((((((.(((((.(((((.((((((((.....)))))))).....(..((((.(((.....))).))))..)..((((.(((..((....))..)))...)))).........)))))))))).)))..))))......((((((.((((((((((((((.(.(((.(((((.(((((..(((..(((((((....(((((((.(((((((((..((((.(((((.((.....(((((((...(((..(((....))).....)))....)))))))))))))))))).))))..))).)).))).)))))))))))..)))...))))).(((((((...((((.((((((..........((((....((((........))))....)))))))))).)........)))))))))).......))))).))).)))))))))))......)))))))))).)))))))))..))))))..)))((((((..(((((...((((((..(((.(((((((((((((.((((.....((..(((.....)))..)))))).)))))))..)))))))))....))))))...)).)))..)))))).)))))))....))))))).....))))))).)))))))))))((((((.(......).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......))((((((.((((((((.(((((((..,((((((((.(((((((((....((....))...}))))))))...}))))))).,...(((((......))))).|.{(((....,,))},,,...(((((({...{{(((((((.{({.(((((((.((((,...,,..,{{{{,,,..}}}}},,|{{,.|||||,.........}||||,.,,{{((,,,,}))|....}})}.....(((((((((((.{{(({,,{{||||.((((((({......}}})))))).{((((..,,,,|}|||,.{{..((({...})))..}}..))))})),,,.)))),,))).)))))))).))))))),,,,.......{,(({{.....{|{{.....,,.,)))}..|,||}|,.{{{(,,((,.{{,((((((((...,,..((.((((((.(((((.((.........)))))))...)).)))).}))}))))))))...,,..}}))|{|,|{,,,..}}.))),,...........({(((((((..(((((((((...(((((((((((((((.....((((.(.((((((((((((((.((.((((((({......|))))))))).)).,,,.........,{.{,,..,,..........})),,..{{{.....)))}))).)))))))).).)))).....))))).))))).))))}.(((((((.(((((.((((,.{(((((((.....)))))))}.....{..((((.(((.....))).))))..}..{{(({{,,.{{(.|,,||,.,||||,,}})..,)},}}})))))))))).)))..))))......((((((.((((((((((((((.(.(((.(((((.(((((..(((..(((((((....(((((((.((((({(({,.(((({((((({,(,.,..{{{(((({,.{({..({,....))),,,.,},}.,,.},,,,)),)))))))))).)))}..)))},).))).)))))))))))..)))...))))).(((((((...(((..{{{{{{.{{{,,....((((....((((........)))).,..)))))))))}.}........)))))))))).......))))).))).)))))))))))......)))))))))).)))))))))..)))))),.,))((((((..(((((...((((((..(({{(((((((((((((.((((.....((..(((.....)))..)))))).)))))))..}))))))))....))))))...)).)))..)))))).))))))}.}}.)))))))..,..))))))).)))))))))))((((((.(......).))))))}))
Forensic Context

No forensic context available.