Basic Information

Symbol
hsa_chr5_0113300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0170
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
5:130766993-130799901 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131431300-131464208 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-470.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -506.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 466.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((((((((..........(((((.(..((((.(..((((.....))))..).))))...).)))))....(((((..(((..(((((.....((((.((...)).))))..)))))..)))))))).(((((((((((((.((((...((((.((.((.((....)).)))).))))......(((((((((.((.(((..((((((..((((..(((......(((((.((((...)))).)))))((((((.((((((((((.((..((((....))))..))..(((((((((((((((((((((...(((...(....)...)))....)))).)))))))))).))))))).)))))))))).))))))((.((((........((((((...(((((((...))))))).......((((((((((((.....)).)))).))))))...(((((((((((((((((.((..((..((((....))))....))....)))))))))..))...)))))))))))))))))).)).(((((..(((((((((((((((((((..(((........)))...)))))))).....(((.(((((.......))))))))..)))))))))))..)))))......(((((......))))))))..))))....))))))..)))..)).....((((((((.((....(((.(((.((.....)).)))))))).)).)))))).....))))))))).......((((((.....))))))))))..))).)))))...)))))(((((...(..((((.(((...((((..((((((.(((.........(((((((((((((.((((.(((.........(((((((((((((((....))))))......(((((....)))))..........(((((..(((((.......))))).))))).........(((((((((....)))))))))(.((((((.((.(((((((((.(((((((((((((.((((((..(........)..)))))).))).))).)))))...))..))))).)))).))..)))))).)......((((((.........))))))...(((((((...))).)))))))))))))..........))).)))).))))))))(((((((((..(((.(((........)))))).))))))))).....((((((..............))))))....(((((((((.........))))))))))))))..........(((((...........)))))(((((((((.((......(((...(((((((((((((((.(((((.((((((.......))))))..................((((.(.....).))))(((((.((((.(((......))))))).))))).((((((((.(((.((....(((((....((((.((((....))))...)))).)))))..)).)))))))))))..............)))))...))))))))))))))).))))).))))))))).....((((..(.((((...((((....)))).....)))).)..))))...)))))))))))))...))).))))..)...))))).......((((((.....))))))..........))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((((((({.....{{,..(((((.{..((((.(..((((.....))))..).))))...,.)))))..}}|((((..((({.({{{(.....{{{{.{{...)).}))),.}})))||||}}||||.,((((,((,,,,|},|||},,||||||,,((||||.,.|,,||||,|}||..,,..{{({{(({({((,(((..((({{(...,{||||.{((((.((({(((((,(((((.,..{|..(((((((.((((((((((.((,.{{{,...{|||,...)}}|{(((((((((((((((((((...(((...{....,...)))....)))).)))))))))).)))))))})))))))))).))))))).,},,..})))}))))|{{{..,{{{({{,.,,}}|||||,{{{{{,((((((((({((.....)).)))).)))))}...((((((((,{(((((((.((,.(({{((((....)))}.,,.)).,,.)))))))))..}}...)))))))),|||,,,))).,,.(((((..((((((((((({(((((((...{{........,},...}})))))).....(((.(((((.......))))))))..)))))))))))..)))))...,{.(((((......))))).}))})))}.}},),,,}}.,)))..)))}}..(((((({(.{...{((({{(((.((.....)).)))))))).)).)))))).....,})))))}}..,,,}}},},.})))}}))}},}}}},,}))},)}},},|}))),}{((((...{..((((.(((.,.{(({,.,,{(((,((....,,.,{{(({{{((((((((.(((({(((.....,,..{((((((({(({{{{...,|||}}},,,,,,{,{{,.,{{||||,.......,,.(((((..{((((....,,,)}}}}.)))))..,,{((,.(((((((((....)))))))))}}}},,,...,,{{{{..{{{{,||||||{{{{,||||||||||,,.....{{{((((.{....}.))))..}}}}}|}}}||}}})).},,,}))))))),)}}}......((((((.,.......))))))...(((((((...))).)))),)))))))),.....,,},.,,.)))).)))))))),,,{{{{{|..,,{.{{{||||||{{||||,{{|,|||,,,.,}}.}}}..,.....}}}}}}}.|{||||||,{..{((((((((.........))))))))}||}||,.....,}|.|||{,.....,..,},))))}(((((((((.((,.....{{{...(((((((((((((((.(((({.{(((((,......)))))),,....,,,,|,......,,,,.|.....,.}}|,(((((.(((,{(((......))))))).))))),|(((((((.(((.((....(((((....((((.((({....,)))...)))).)))))..,),))))))))))},,,......}}},,)))))...))))))))))))))).))))).})))))))).....{{{{{{({(.,,.((((((...{{{,....}}),,,,,}))))).})))),))))))))).,.))).))))..}...))))).......{(((((.....)))))}..........})))))))).
Forensic Context

No forensic context available.