Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0003300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0172
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130775274-130828478 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131439581-131492785 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-580.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -622.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 694.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((..((((((.(((.........((((.........))))))).))))))((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))((.(((((..((((((...((((((......((((..(((((((.....................))))))).....))))........((((........))))((((.(((.....)))))))......((((((....))))))))))))))))))..)))))))(((....)))((....)).............((((((.........)))))).))))))).))).....((((...((((...((((..(((.....(((((((..((((((((..............((((((..((..(((.......(((((((.....))))))).......)))))..))))))...(((((((..(((....)))..)))))))..............(((((((.((.((((....)))).))..(((((((....(((.(((.(((((..((((.(((((((.(((((((((((.....)))..(((((..(((......(((((((((((((....)))....(((.((((((.((((((((((..((((((....((.((....)).)).....)).)))).((((....))))...........))))))))).).)))))).))).((((........)))).....((((((((((((((((((((.((((........(((.(((((...(((((.((((((......((((((((.......(((..((.(((...(((((((.........))))))).))).))..)))...((.((((..((((((......(((((((((...(((..(((((((((.(((((((.(.((((...((.((((..((...((((.((.....(((((.....)))))......)).))))...))))))))...)))).).))))(((((((((((...........(((.((....)))))..(((((((((((((....((((......))))......)))))))))))))(((((.((......(((.(((.....))).))))))))))...........)))))))))))..........(((((((........(((.(((....))).))).))))))))))..)))))))))...)))..)))))))))........))))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))(((((.........))))).......((((....))))...((.((((((((.(((((((((((((........))))....)).)))))))..)))).))))))........(((.((((.......((((((((((((.(((((..((((.((....(((((((.......)))))))....((((((..((......))..))))))((((((((.(((((((((....((....))...)))))))))...)))))))).....(((((......))))))).))))))))))))..))))).)))).)))).)))))))))))).)))))....)).))))))))))))))))))..)))..)))))((((((.........)))))).((.(((((((..((.....))..)).)))....)).)).((((.....)))).((((((...........)))))).(((((......))))).))))).)))..)))))))..)))).))))).))).))))))))))..((((......))))...........((((.....((((.........))))....))))(((((((((((.(((((((((((...((..((.((((((.(((((.((.........)))))))...)).)))).)))))))))))).........))).))).)).....((((.(........).))))))))))........((((((........((((((......))))))........))))))..((.(((((((........)))))))))))))))))))).))))..).))))))..)))..))))..))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((((..((((((.(((.........((((.,{...|,.})))))).)))))}((((((.((((.(..,,(({......((((((((.(((.({.(((..((.....))..))).))))).)))))))),.......})}...}.)))).))))))(((((...))))){{.(((({..((({{{,,{((({{{,,,,|{{{((..(((((((.......,,,,..........)})))}).....))}},,......((((,,,,....}}},((((.(((.....))))))},{{,,,(((((||{{{||,,,||||,||}}}})),,))))))},||},,.},)||}}}}}}}}}.,,,,.,...((((((.........)))))).))))))).})).....((((...((((.,.((((..{((.....(((((({..((({(((,..........{,..{{{(((..{{..(((.......(((((((.....)))))))..,....)))|}..)))))),|,(((((((..(((....)))..)))))))....,.....,..,{(((({{.,|.|||||{{..||{(({({(((((((,...{{{,(({.{{{{|,,{{((,((((({{.{{{{((((||{,,.,||||,,||||||,{,{.,,,,,{(((({(((((((....})))},.|{{,((((({.((((((((({..,{{{{({{,,,,.{{....,,.,}.,,..}}.)))),|(({....))))...........})))))))}.).)))))).}}|,{{{{.,......})))},...{(((((((((((((((((((.((((........{{{{{((((.((((((((((((((,{,...|}}|}|,....}))))),..}})))))))|{{((({,{,,,....||}|||,.,...}|,.||,..||||{({{..{{||{,......{{(((((({...{,,..(((((((((.{{((({{.,.{|||.},||,{{{|..{{...{{{{{{|..,.,||||||,,||}}}}},}}},})).)))}...}))}))}},..||||||.,,{((((((((((((,...,{{{,..{,,.{{.,..,,)))..{((((((((((((....((((......))))......))))))))))))|(((((.{,.....,(((.(((,...,))).))))))))))}.....,,.,.})))))))))))},|{.....{{{{{{{........(((.{({....}}}.})).)))))}}}},,.)))))))))...}}}..}))}}}))}.,......}}}|||||||,..||||||,{{{|,|||,,|||})}}}||,.((({(.....,,,.))))).......||||..,,||||...((.((((((((.{((((({{{((((.,......))))....}}.)))))))..)))).)))))).,,},}}}({(.((((.......(((((((((((({((({{..,,,{.{{..,.(((((((.......)))))))....((((((..((......))..))))))((((((((.(((((((((....((....))...)))))))))...)))))))).....(((((......)))))}}.)}})))))),))}})),},})))).)))).)))))))))))).)))},...,)).)))))))},}}}))))))},)}}))))},,((((((.........)))))).||,|(({(((..((.....))..)),,|||...{|,||.{(((.....)))}.(((((({{......}}})))))).(((((......))))).}}}}}||||..}))))}},,}})),))))}.}}),))}|||)})|,,|{||.|}||||}},.....,,..|,(({{.....((({.........))))..,.)))}||||||}},||,|||((((((((....,..((.((((((.(((((.((.........)))))))...)).)))).})}})))))))).......,,,}}|},|({{.....((((.{........).)))).,.))),.......{(((((.,......((((((......))))))......,.)))))}..{{.{((((((,......,))))))))))))))))}})).))))..}.))))))..))),.)))).,))))...))))...
Forensic Context

No forensic context available.