Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0010200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0165
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130797398-130857214 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131461705-131521521 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-607.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -660.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 705.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((..(((.((((......(((((((.......(.(((((((((.(((...))).)))((((((.(((.(((..(((((((....((((.....))))((((....))))..(((((....))))))))))))))).)))..))))))...((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).)))))).)..........(.((((.(((..(((((((((((..((((....)))))))).))))))).))).)))).).......((((((((((....((.(.(((...(((..(((.(((.((((((........))))))..))).)))))).))).).))))))))).))).(((.......))).)))).)))........)))))))...))))))))((((((((((((........)))))....((((((((((.((((......))))..))))))......))))(((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..((((.....(((((((((((..((((((...((((((((........))))))))...((...))(((.(((.(((((((((((....((((((...........((((((((((..............)))).)))))))))))).....(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((((((.((.....))))).....))))))))..................))).)).))).))).))))......))))))))))).)))))).(((((....)))))..))))))(((((((((.((.((((((((..((((((((..(((((((((((((.(((.(((.((((((....((((((.(((((...)))))))))))..(((((((((..((.((((((((..............((((((((...............))))))))..............)))))))).)))))))))))..))))))((((((...(((((....(((((((((....(((((..((((((......(((....)))........))))))..(((((((((((...((((((..((((((.........((((((...((((((((((....)))))..))))).((((.((...))..))))...((((..(((((((.....................))))))).....))))........(((((((((.......((((.(((.....)))))))(((...(((((.((((((....(((.((....))))))))))).)))))...))))))))))))))))))....((((((.........)))))).((((..((((((.(((.(((((..(((((((((((..(....(((..((((.((........................)).))))..))).......(((((((.....))))))).........)..)))))))))))(((((((..(((....)))..)))))))....((..(((....)))....)).((((....)))))))))))).)).))))..))))...)))))).))))))....))))))).))))))))))))).)))))...))))).....))))))..((((....)))))))))).))))))))))))).))))).)))((((((.(.((.............)).).))))))....(((..(((..........)))..)))...(((((....((((.....))))..))))).........)))))))))).).))))))))...((((((((((((.((((((((((((((.((....)).)).....))))))...))))))))))..((((((.((...((((((.......(((.(((((((((((......)))...........((....))....(((((.((((...(((......))).))))....)))))..(((((((.......))))..))).....)))))))).))).....))))))....)).))))))(((((((((((((...........(((.((....)))))..(((((((((((((....((((......))))......)))))))))))))(((((.((......(((.(((.....))).))))))))))...........)))))))))))))........(((((((........(((.(((....))).))).)))))))...))))))))........))))))))))))))).))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({{(((((({.{{|||,|,((((({.{,,,....,,((((({,(({((({,.,.|,|||(((((({(((.,(({{(,{,,,,...}}}}|,}}},|}))||||.,,,}}}}|||||{{..{{|||,,|||,},.,,)}),,}})))))}}},||{|.{{|{{{.((({{,,...}}})),)))})),)))).)))))},,....)},}}}}.{(((.(({..(((((((((((..((((....)))}))))|})))))).}}}.)))).,.........(((((((({{{((((((((..{,((,.,(,,.,(((((.((....)).))))),|(,((({,{{|{,,,((({,,{{({|{{{|.,{,{({...||}|,|||,,,{{{{{{{{{{,.{{{{|||{|{({{{{{.,.{(({{{{{{,,.,.,))}})})...)))))}.}})|||||,|{{|......,}}}.}}})|,}}}}}}))})}(((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.)))))))..}}}).}})))))})}}}}))})))}......}}.}})})))))))))))))))))}..,,,||||,,{{,..{(((((((((,,.{((..(((((..........)))))..))),,|,.,.{(((((((..{(({,(({,.,..,,{{{{(((.....,,,}}|(((((({.(({.{(..(((..(((((((({{.{((,....}}}}}.....))))))))...,,....,,,,....,})}.}}.})}.}}},,}}}..{({(({....}))))),,{{{{.(((((....}}}}).}}))}|}{{((((({{,((.((((((((..{{{{||{|..(((((((((((((.(((.{{{.,(((({....{{{{({.{{{{{..,|||||}||}}}..(((((((((,..(.((((((((...,..,.......{(((((((...............))))))))........,,}...)))))))),}))))))))))..})))))((((((...(((((..{.(((((((((....(((((..((((((......{((....}}),.......))))))..(((((((((((...((((((..((((((.,,,.,,..((((((,,.((((((((({..,,))))}..||||}.(({{,,,,{{{{,.|||,,,,{(((..(((((((.......,,,,..........))))))).....)))},.......(((({{{{,...,,,,{(((.(((.....))))))}{{(,,,(((((,{{{{{|,,,||||.||,,,,)),,))))))},||}},.},)))))))))))})))))),,,.((((((.........)))))).((((..((((((.(((.(((((..(((((((((((......,({(..{{{{.{{....,.............,.....)).))))..|||.......(((((((.....))))))).......,,}..)))))))))))(((((((..(((....)))..))))))).....,...{((({,,,|,....},))})),...,..)))))))).)).))))..))))...)))))).))))))....))))))).))))))))))))).)))))...))))).....)))))){{((((....))))))}))).))))))))))))).}}}}}.))){((({{.|.{{...,,,..,,},.,},},))))||,,..,{|}}|{{..........))}..}}}...{{(((,..,{{{,...,,}}||,,|}}}}.}}},,...)))))))})),),))})))}}.,))..))))))||{.(((((((((((((({(,...})),)}.....)))))),..})))))},,...}))))))))),}},}}||{......}}}.,},,.)))))).{{{{{.,,.......{((((((((...({{..(((((((((.(((((((.{,({{{...,,,((({..((...((((,({.....{|||{,..,,|||}}.,||,})).)))}...)}})))}}}..))}|,|.,,{((((((((((((,...,{{,,..,,,.{{.,..,,))}..{((((((((((((....((((......))))......))))))))))))|(((((.{{.....,(((.(((,...,))).))))))))))}.....,,.,.})))))))))))},||.....{{{{{,{........{{{.{{{....}}}.})),))))))}}}}..)))))))))...}))..))))))))),....))))},.
Forensic Context

No forensic context available.