Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0015600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0207
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130825239-130940386 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131489546-131604693 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-466.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -501.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 509.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((........((((((((.........))))))))............(((((.((....((.((..((((....))))))..)).....)).)))))(((((((.((((((((.((((((((((...((((((.((((((((.....))))).)))....))))))((((((.((((.....))))..)).))))...(((((..((.((((....)))).))..))))).)))))))))).))))))))))))))).....(((((((((((((((((((((.((((............(((.......)))...........)))))))))..))))))(((((......)))))...............((......))....(((((((((....((((((.........(((((((((((((.((.(((((((...))))).)).))............(((((((((.(((...))).)))((((((.(((.(((..(((((((....((((.....))))((((....))))..(((((....))))))))))))))).)))..))))))...((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).)))))).)))))))))))))((((.(((..(((((((((((..((((....)))))))).))))))).))).)))).........((((((((((....((.(.(((...(((..(((.(((.((((((........))))))..))).)))))).))).).))))))))).)))......))))))))))))))))))))))))).(((((.(((((...(((.((((((((((.(((((...(((..((((...((((((.((((..(((((((.....((.(((((((((((((((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..((((.(((.((.((((((((((............))))))).))))).)))))))(((((((..(((((((((((((..((((((((((((.............((((.......(((((.....(((((((.(((.((............(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((((((.((.....))))).....))))))))..................))).)).))).))).))))..((((((....)))))).......)).)))))))))).....))))).......))))..............))))))))))))((.((.((((.....)))).))...))((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))))))..)).......))))))))).)))))))).))...)))))))....(((.((((.......(((.....))).((((((.(((.........((((.........))))))).))))))((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))((.((((..(((....((((((......))))))..)))...))))))...)))).))).....))))))))))))))..)))..))))).)))))))))))))..)))))..)))))...))).)(((.....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((((,.{(((((((((..{{{,{{{....|||}.||,..(((((,((....,,.{{,{((((....))))},..}},,...)}.))))}(((((((.((((((((.((((((((((.,((({(({,(({{{((({,.,|}||}}.}}),..,,})))))||,,|,{,||.,,,{||||{....))))}}.(((((..((.((((....)))).))..))))).)))))))))).)))))))))))))))....|..{({....)))..}|((((.....))))}})))))).)))))))))))).......(((((((((((({{(({{{{{.(((((,....,)))))........,,.....,...(((....((((.((((.......)))).))))....))).((((((((((((.((({(((({.,,,}}}|,((((({.{,,,....,,((((({,(({((({,.,.|,|||(((((({(((.,(({{(,{{,,,...}||||,}}},||))||||.,,,}}}}||((|{{..{{|||,,|||,},.,,)})},}}))))}}}},||{|.{{{{{{.((({{,,...}}})),)))})),)))).))))),,,....)),}}}),{{{{,{{{..(({({{{((((..((((..,,||}}}}||||}}||||,|}}.)))),,..,,,,...(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.{(((({{({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{{(((((,.((((,{,({{((((((...(((,|{,|{,,..,,)))})))...)))))).))),,,,},||||......,}},.}}}},.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..))}).}})))))})}}}}))})))}......,}.},)}))))))))))))))))))..}}}),))}|,.,,.,|||.,.|||||.,,(,.{{{||.......,.,)))))..)))..)))))))))))).}})))}.)))........,..(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((({{,{((.....)))}}.....))))))))..,,,....,.,......))).)).))).))),,)))..((((((....)))))).......))))).)))))))..)))))(...((((((((((((((((((((....))))))}..))))..((,((({.....|}}|,||,{.{{({{{{{,((({,,,{{||,,,,||||||,,{|||||||.,{.{{{{{|||...,,,{....,.,{(((((((.....,.........)))))))}.......,|||...})))))))|||}|}}}},,,,.,.{(((.,||,,|{.,||||,,,||,,,,((((((.((((,(,..,{{{......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))....,,,,})}...).)))).)))))){((((,..)))))||,{|{{.,|{|,...||||||,}}}},,|||{|{..(((({({.........,,..........)})))))...,,))}),,......((((........))))((((.(((.....))))))))))))))))..)
Forensic Context

No forensic context available.