Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0016300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0201
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130828275-130867887 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131492582-131532194 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-339.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -367.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 410.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((....(((((......))))).((((.....((((((......(((.((......)).))).......))))))))))...))))))...))((((((((((((((.((((((((.........((((((.(((.(((((....(((..(..((((.....))))..)..)))))))).))).(((((..(((...((((.(((((((....)))))))))))...))).))))).))))))...))))))))..))))....((((((((((.(((.(((((..((((..(.....)..))))...(((.((....)).))).))))).)))...((((((......((((.(((((((...))))))).))))...((((((((((.((((((((..((((..((....(((((.((....)).)))))..((((.....((((.((((..(((((((((.((.(((....))).))....((((((((((..((((.(.(((((((((...(((.....(((...)))..)))...)))))).))).......(((......)))).))))..)))))))).))(((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..)))).)))))))))...))))))))......)).))))))))))))))))))))))....((..(((((((((((((..((((((((((((.............((((.......(((((.....(((((((.(((.((((.(((((....(((........)))..(((...((......)).))).)))))))))..)))))))))).....))))).......))))..............))))))))))))((.((.((((.....)))).))...))((((((.(((((...)))))))))))..)))))))))))))..))...))))))......((((.((((...)))).))))......))))))))))....((((((....)))))).(((((..(((((...((((.........))))..........((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))..))))).)))))....)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((...,(((({....,.}))}}{(((........)))){{(({(((((({{,...,{{({.,..((((((((.(((((.((((((...((..(((((((((.{(,,,.{(((((({.({{{....,,{{(({,((((((,..,,.{{(,,((((((({{{..(({{(.|..,,,,.)))})}}}||||})}}|,.},|{,(((((((((....)))))))))||{{.}||.,,,))..)))),,.{|||||||,,..,,..,}||||||||.,,,|,}}}))},)}))))).)))}).}}....)}})))).((((.(((..(((((((((((..((((....))))))))}})))))).))).))))...........(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.{(((({(({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...{((,|{,|{,,...,)))})))...)))))).))),,,,,,||||......,}},.}})),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..)))).}})))))})})}}))})))}......,}.},)})))))))))))))))))).....))))..))...)))))).{((((...((....))...}}}},.)))))...)))))))).,},.||,,,,,,,||.||}}}}}}})))}.}}}))}.})))))))))(,{,((((.(.,,{{,(,{...}},.(((((({...}))))))..|||||||{{{.(((({(,(((((((((....))))))}..}}}},.||,|{{{.....}}}|,||,{.|,({{{{{,(((,.,,{{||,.,,||}}||,,||}}}}}},}|.,{||,||},,.,..|,,,}}}}|{||||||,,,.,,,.......,}}}}}}}},,....,||||,..,})))))}|||}|||}},,,....((((.{{,.,|,.}}))|,,.}},,,,((((((.((((,(,..|{{|......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))....,,,,})}...).)))).)))))){((((,..}})))},,||||,,,,)},..).))))..)).)
Forensic Context

No forensic context available.