Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0016400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0129
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
5:130828275-130868356 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131492582-131532663 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-452.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -490.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......(((((......)))))((((((((((.......(((((.......)))))...((((((((((((.((((((((..((.((((((..(((.(......(((((.((...(((((((.(((((...(((((..((...)).)))))((((((...((((((((.((((.(...((.....(((.....((((..(((((.(((....)))...))).))..)))))))..)).).)))).))))))))..))))))..((((((...))))))........))))).....)))))))..)))))))....).))))))))).)))))))))).(((((((........)))))))....((((((((((....))))).))))).......))))))))))))(((((....((((((...............))))))...)))))........((((((((((((((....(((((......)))))((((........))))..((((.(((..((((((.((....((((((.(((....((((((..((..((((((((.((....(((((((((.((((...................))))...)))))))))..)))))).))))..)).((.((.((((.....))))))))(((((((.(((((((....)))))))))))...)))..)))).))..))).)))))).((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).))))))))..))).))))(.((((.(((..(((((((((((..((((....)))))))).))))))).))).)))).).......((((((((((....((.(.(((...(((..(((.(((.((((((........))))))..))).)))))).))).).))))))))).)))......((((((.((.(............).))))))))))))))))))))))...))))))))))((((....))))...(((((((.((((......))))..)))))))...(((((((((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..((((((((.(((...(((((((............)))))))((((.(((((((....(((.............((..((.(((((((((((.............((((.......(((((.....(((((((.(((.((((.(((((....(((........)))..(((...((......)).))).)))))))))..)))))))))).....))))).......))))..............)))))))))))))..)))))....))))))).))))...((((((.(((((...)))))))))))..(((((((((..((.((((((((..............((((((((...............))))))))..............)))))))).)))))))))))...))).))))))))................((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))........))))))))).((.....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,,{....,,,,({{{{..,,,,,.))))}.,,{{,{.,,{({(,(((({..,{{{||...((((((((((((.((((((({..{{.((((({..(((.(......((({{(((.,.((((((({(({((,.,(((((,,((...||{|||,.((((((...((((((((.((((.{...((...,.,.{.,,..{{{{..,,.,,.||||...|||...||||,,..)))},})))),.}.)))).))))))))..))))))..,|||||...),)},,}},,,,,.}}))).}}).)))))))..)))))))....).)))}))))).)})))))))}.(((((((.,....,.)))))))....((((((((((....))))).))))).......)))))))))))),,,,,.|||||||||},...}}}.}},,}.,,|}|{{{{{{{.,(({{{{{({{{{(((((((({{.,,,{{||,....|||||||{{{{..,.....))}}{(((((,(((((,.....}|,.....((((((((.(((((.((((((...((..(((((((((.{(,,,.{(((((({.({{,....,,{{(({,((((((,..,,.{{{,,((((((({{{..(({{{.|..,,,,,)))})}}}||||})}}|,.}}|{,(((((((((....)))))))))||{{.}||.,,,))..)))),..{|||||||,,..,,..,}}|||||||.,,,},}}}))),)}))))).)))}).}}....)}})))).((((.(((..(((((((((((..((((....))))))))}})))))).))).))))...........(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.{(((({(({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...{((,|{,|{,,..,,)))})))...)))))).))),,,,|,||||......,}},.}})),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..)))).}})))))})}}}}))})))}......,}.},)})))))))))))))))))).....))))..))...)))))).{((((...((....))...}}}},.)))))...)))))))).}}}.}}}}}}..|||,||||.|}}}}||,,{((,,....,|)))}||},..}||}}}}||}|,{||.,,}},.(((((({...})))))}..||||||{{{{.(((({(,(((((((((....))))))}.,}}}|,.||,|{{{...,.}},),)},,.,,{{{|{{,{{{,,,,{{||,,,,|}}}||,,|||}}||},}|.{{||,|||,,.,..},,,}}}}|{||||||}},.,,,.......,)))})))},,.....||||,..}})))}))|||}|||,,,,,....((((.{{{.,||.,}}||,},|},,}}{{((({.{(((,{,..||||...,,.((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))...,,,,,}),...).)))).)))))}(((((,..}})))}}.,|}}}},,}}}}}},||}}}}))}.
Forensic Context

No forensic context available.