Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0016800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0109
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:130831246-130897740 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131495553-131562047 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-325.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -353.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 381.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((.((((((.(((((...(((((((((((.(((.......(((((......(((.(((((.....)))))..)))..)))))......((((......)))).....))).))))))))(((((......)))))...............((......)).((((.((((.......)))).)))).)))....))))).)))))))))))..))))))))))((.((((..((((...(((((.(((((((((...((((.(.((((((.((((..(((((.........)))))...(((.((((.(((((((((.((((....(((((..(((......)))..)))))(((((((.(......)))))))).)))).))).)))))).)))))))..))))..))))))).)))).((((((..((((...((((..((((..((((....((((.(((((((...))))))).))))...((((((((((.((((((((..((((..((....(((((.((....)).)))))..((((.....((((.((((..(((((((((.((.(((....))).))....((((((((((..((((.(.(((((((((...(((.....(((...)))..)))...)))))).))).......(((......)))).))))..)))))))).))(((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..)))).)))))))))...))))))))......)).))))))))))))))))))))))..)))).)))))))).))))..))))))..))).))))))........((((......)).))..)))))((((((((((((((((.........(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((((((.((.....))))).....))))))))..................))).)).))).))).))))..((((((....))))))..((((.(((((....))))).)))).((((....((((.(((((((((((....)))))))..))))..))))...))))....(((.((...((...(((((..((((........))))..)))))...))....)).))).)))))))))..)))))))..................))))..)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((({{{((((((.(((((,,.{{{((((((((.(({...,,..(((((......,{{.(((((.....)))))...,,..)))))......{{|{......}},,.,}}.))).))))))))(((((,....,)))))...............{{..,,,.,,.((((.((((.......)))).)))).}}},)}.))))).)))))))))))..))))))))))((.((((..((((...(((((.((({(((((,,.{{{{,{{(((((({{(((.{(({{(,{{,,{...}||||...|{|}||{{|{{|{|||||.{(((,,..{{|||,,|||,,,.,,)}),,}})))|||||{{,{,.,,,,||||||||,|}}},}}},,)))}).})))},),,,}}}..,,}}},..,|.{{{{.{{{..(({{{{{((((..((((..,,||},}}||||}|||||,|,,.)))),},.,,},.,.(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.{(((({(({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...{((,|{,|{,,...,)))})))...)))))).))),,,,},||||......,}},.}})),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..)))).}})))))})})}}))})))}......,}.},)}))))))))))))))))))..,}||.||||,,,|.||||,,.,||||.,|||.|||||,........{|||,,...,)}.))|.))))){{{{{{{((({(({{,,,,.,,|..(((........)))(((((((.(((.((..(((..(((((((({{.{((.....)))}}.....))))))))..,,,....,.,......))).)).))).))),,)))..((((((....))))))..{(({.(((({....))))).})))|({{{{{,.((((|{,{{{((((({....))))))).,}})},.||,||||,,.,.,,,|{|,{{.,,{{,,,({(((..{{({,,....,,))}}..)))))},}))}..,)).))),)))))))))||)))}})),,,}},..||,.......))))..)))).))
Forensic Context

No forensic context available.