Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0020800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0126
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
5:130857083-130885920 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131521390-131550227 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-633.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -681.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 599.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....((((((((..((..(((((((((((((.........)))))))..))))))..)).((((((....(((((..((((((((((.(((((((((.(((...((((((...(((((((...............((((.(((.((......(((..((((....))))....))).........)).))).))))...............)))))))...((((((.(((((((((((.(((((((((....((.((...)).)).))))))))).)))).....................(((....)))...((((((............(((((...((((((.((((((((((((((.(((((...((((.........((((((.((((((((((((.((..((((((..((((.((((((((((((..((((((....(((((.(((.((((((.......(((((...(((((((((((.......))))((((((((((((((.................))))))))))))))...((((.(((...))).))))(((((((..(........).)))))))....((((.....)))).......((((((....))))))....(((((((((((...((((.......(((((......((...(((((((.(((.(((((.(((((((......((..(((((((((((....(((((......)))))..)))))........))))))........)).....))))))).))))).))))))))))...))..((((((.(((((((((...))).)))))))).))))..))))).......))))...))))))))))).(((..((((((((...)))))))).)))....)))))))...))))))))))).))).))))).....(((.(((((........))))))))((((...(((((((((((.(((..((.....))..))).)))))))))))....))))...........))))))))))))((((......))))...))))))..)))).....)))))).)).)))))))))...))))))))).))))))))).)))...((((((((........))))))))..(((((((......)))))))(((((((.(.(((.((.(((((..(((....))).))))).))))).)...)))))))........)))))))))))((((..(....)..))))(((((...)))))...)))))))))))...........))))))))))))).))))))...))))))))).)))..)))))).))).)))))))))))))))))).((((((((((((((.....((((.....))))(((((((((((....))))).)))))).......((((....))))(((((((((((......................)))))((((((........(((((.......(((((((((((....((((((((.....)))))))).(((((........))))).....(((((.....((........))......))))).(((((((((((((((((((...(((((((..................)))))))....)))))))))............((((((((((((..((((.((.(((((((((.................((((.(((((...(((.........)))...))))).))))((((((.((.(((((..((((...((((((((((((((((.....))))))...))))))....))))))))..))))))))))))).....)))))..))))..)).).)))))))))))))))...(((((.((((((...............)))))).))))).((((((....))))))....(((((((.......(((((....((.(((((((....))))))).))......)))))(((((.((((............(((.......)))...........))))))))).)))))))...)))))))))).))))))))))).....))))))).))))((((.((((.......)))).))))))))))..........)))))).(((((((...))))).)))))))))).....)))).))))(((((((....(((..(((((((.....(((((.........))))).....)))))))..)))..))))))).))))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((,,..((((((((..((..((((((((((((({....,},..))))))..))))))..}}.((((((....(((({.,((((((((((.(((((((((.(((...((((((...(((((((...,,.,,......,({((.(((.,,......|||..((({....})))....},|{{{....}})).}}}.)))).......,,.,,...)))))))...((((((.(((((((((((.(((((((((....,{.(,...}).}}.))))))))).))))....,,...,,.,,....,.,||{....}}}...((((((.,,.......{.((((({..((((((.((((((((((((((.(((({..,((((.,,..,,{.,{{(((,((((({{{{{{{,||.,|||||,..,,,,.{(((,{.,,,..,{(((((({((((({{{{{..,,|||,,.,,,..||||||||,.((((({{(((.......))))|{{(((((((((((,,...............))))))))))))),...((((.(((...))).))))(((((((..(........).)))))))....((((.....))))..))))}((((((....)))))).|,}||||||{((({...((((.......{((((.,,,,,((...(((((((.(((.(((((.((((((({{{...{,..(((((((((((....((({{......}}))).,)))))........))))))........}}..,}.))))))).))))).)))))))))).,,||{,((((({.(((((((((...})).))))))||,||||.,}||}}..,,.,,}))),,,))))))))))).}},..{(((((.((({.{(|||....}))).}))).))))}},,},,)))))))))}...{{{{{...((,{(((((........)))))))).{,|}}}|((((((((((.{((..((.....))..))}.))))))))))}...,}}}|,,,,,....}}}}},,||||{{{(,,,....}})))))).)})}}).}}))).}},,)))}}}.}},))))))))).,,)})))}})).))))))))).))){,,((((({,,.,,,},,,)},},,}}..(((((({......}))))))(((((((.,,(({{((,(((({|,|.|},.,))}.}},})})))}}.....))))))),,......}))))))))))((((..{....}..))))(((({...))))).,,)))}})))))).}.......,.))))))))))))).))))))...))))))))).))}.,)))))).))).)))))))))))))))))).{((((((((((((,,{{{.....(((((((((..(((((({({(((,{...|||}}|}||{,..,{((((...,||||(({{|{({{{,.....,,,,,.,..,,,,|,||||,||{|||||..,,,,...{{{(...{{{(((((((((((({{.{{((((((,.{{{{||,,{(((.(((((........))))).,)}),|,,.}})))).))}}},.,|{({{.{{{,,,...}}}.}})}|(((((((((...(((((((..................)))))))....)))))))))}.,|,.|{||{{||{(((((((({,,{{({{,,.|||{{{{{{,..,,,|,{{|,|||,{{(({|,,,,,}}}}))}.}}},,,.|||||,}}.,}})))|((((((.((.(((((..(({{...{{((((((((((((((.....))))))...))))))....))))))))..)))))))))))))},....|||..,||||{,,,.}})),}))}|||}}}||...{{(((.((((((.,.,,.....,....)))))).))))),((((((....)))))},,,,}}}|}}},}}},.)))))}},..}|}||||||,...}))),}}},}}},})})}}.}))))))))))..))))))))).,|.{||,,,,.,}}}.,..{{||{{|,{{{{...,|..|{{.(((((,....,)))))...,,,..,,....})}},(((....((((.((((.......)))).))))....))).,,)))}}})))))).{{(((({...))))).),)))))))}.....)))).))))(((((((,...(((..((((((({{{..(((((.........))))),})},}}))))),.)))}.))))))).}}))|,,..}
Forensic Context

No forensic context available.