Basic Information

Symbol
hsa_RAPGEF6_0024500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RAPGEF6_0246
Host gene
RAPGEF6
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
5:130958568-130960027 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:131622875-131624334 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-376.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -404.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 341.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.