Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0135409 hsa_circRIMS2_010 hsa-RIMS2_0001
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:104897526-104898451 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103885298-103886223 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-212.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -231.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((..((..(((((((.............(..((....))..)....((((((((((.(((..(((((..((((((((.(((((......(((((.(((((((......))))).)).)))))....((((...((((..((.....))..)))))))).....((((((((.((((....))))...((((..((.(((((.......((((......))))......))))).))....))))........(((...(((((..((..((((.(..(((((.........)))))..).))))..))..)).)))......)))....))))))))........)))))))))(((((...((((.....)))))))))....))))))))))))))))))))))(((....)))...(((((....))))))))))))..))...)))))).(((((.((((..((((.....((((((((..(((.(((((((((..((((.((..(((((((.(((...)))))))..))).((((((..((......((((((.......))))))............(((((((......)))))))(((..(((....)))...))).......(((((.(((((((((.........((((((...((........))...)))))).......................((....)).......((..(((..........)))..)).....))))))))).).)))).....))..))))))..............((((........)))).))))))..)).)))))))...(((((......)))))))).))).)))))....))))..))))))))).(((.........))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.......,{({{(((..{(,.{{{{(((.............{..((....))..,....{(((((((({,(((..((((({.{(((((((.(((((,{{...(((((.(((((((......))))).)).)))))...|||{{...{{((,{{{....,}},,}}}}}},,.....((((((((.((((....))))...((((..((.(((((.....,.((((......}))}......))))).))....)))}........(((...(((,{..((..((((.{..(((((.........)))))..}.))))..)),.},.)))......)))....))))))))........))))))))|(((((,..((((.....))))))))),.,,),,)))))))))))))))))))(((....))),..(((((....))))))})}|||.{||,..,|||||.,{,,|||||,.,|||,,,,,,((({{{{{..{{{.(((((((((..({{{{((..(((((({.{((....)))}))..))).((((((..((,.....((((((.......}})))}............(((((((......)))))))|||..{{{....}}}.,,),,..,,,,.(((((.(((((((((.,,..,,..((((((...{(,,,...}}))...))))))..............,........,{....|,.,,,,..{{..{{{,,,,.,,..,)},..)),}}..))))))))).).)))).....))..))))))..............((((........)))).))))))..)).)))))))...(((((......))))),}}.}}},|}}||,...}}})..}}})}))}}.}}|.....,...,,},,..,,......,
Forensic Context

No forensic context available.