Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0014700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0135417 hsa_circRIMS2_019 hsa-RIMS2_0243
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
8:104928616-104987734 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103916388-103975506 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-257.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -278.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 197.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((((.............))))))))...))(....((((..(((.(((.((((....((((....((((((((...((((.(((((((((((..((((...(((((((.((((((...)))))).))))..))).(((((((.(.(((.......)))))))))))..(((((((....(((((((....((((((.((..(((((((((...(((((((.......))))))).........(((((((...((((((((...((.(((....))).))(((((....)))))..(((((((((((.((((((((.....((((((......))))))))))))))............)))))))).)))(((((...)))))................(((((........)))))))))))))...)))))))(((.((((((..............((((((((((((........((.......)).........(((.....))).........((((((....(((((((........)))))))....))))))...(((((......)))))(((((...(((...(((..(((...)))))).)))...)))))....)))))))))))))))))).))))))).)))))..)).))))))....((((((...)))))).((((...))))....)))))))..))))).))(((((((.((((.((((((.....(((((((((....((..........))...))))))).))........)))))).)))).))....)))))...(((.(((((.(......).))))).)))).)))..))))).)))))).))))..(((((((.....)))))))....)))))))))))).(((((((..((......))..)))))))......(((.(((........)))))).((((((((.....))))....))))..(((((.....)))))...)))))))..)))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{,.(((,((((..{{{{.......)))),},,})}).|,,..((((..(((.(((.((((....((((....((((((((..,((((.(((((((((((..(((,...(((((((.((((((...)))))).)}))),})).(({{{{(.{.{,,....,..}},,}}}}}}|{,,,{{{{{....(((({{{,,,|{(((((.((..(((((((((...(((((((.......))))))).........(((((((...((((((((..,(({(((.,{{||,.,.{{{{,....,))))}.|||||||{{({.((((((((.....((((({......)))))))))))))}........,{|,|||}}}||,,,}{{{{|}},}}}}}...,,,,,........(((((........)))))))))))))...)))))))(((.((({,............,{(((((((((((((...,....{|........,.........,{{.....,||.........{(((((....{((((((........)))))))....))))))...(((((,....,)))))|.,{(,{{{(({({(,,..{{|,,,)),})}...||{|}}}})),,.)))))))))))))))))).))))))))))}))..)).)))))},|,.((((,{..,}))}}}.((({...})))....}}}))))..))}}}.}}|((((((.((((.((((((.....{((((((((....((..........))...)))))))},)........)))))).)))).)}...}))))}...{((.(((((.{.....,).))))).)))),)))..))))),}))))).)))},.(((({(({,,..}})}))),,..)))))))))))).(((((((..((......))..)))))))......(((.(((........)))))),((((((((.....))))....)))).,(((((.....)))))...)))))))..))))))).....
Forensic Context

No forensic context available.