Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0020400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0135429 hsa_circRIMS2_031 hsa-RIMS2_0091
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:104948779-105026843 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103936551-104014615 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-268.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -289.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...................(((.....))).........((((((....(((((((........)))))))....))))))...(((((......))))).........((((.(.((.((((((((.......((((....)))).(((((........((((.(..(((........)))..).))))....((((((...)))))).((((...))))....((((((....(((....(((((((.((((.((((((.....(((((((((....((..........))...))))))).))........)))))).)))).))....)))))....)))....))))))(((((.((((..((((((((((((...((((.(.((((((((((.(((((......))))))))))..........(((((((..((......))..)))))))......(((.(((........))))))........((((((((.((...((((((((((.......((((.((..(.((((((..((((((.........))))))..))))))..)..)))))).((((.(((.(.(..((((....((....))....))))..).).))).)))).((((....))))...((((......)))).)))).)))))).)))))).)))).....)))))....).))))....))))))))))))..))))))))).(((((((((....((((........)))).(((((((((.(((...(((((.(((((((.....((((((........))))))(((.....))).......(((........))).))))))).))..))).....))))))))...))))...(((((((.(((((......((((......))))(((((((((.(((....))).))))....))))).......)))))..)))))))......)))).)))))))))).))))))))))).))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,.................,{{.....,}}..........((((..,(,....))..))}}.,.,{(((({{(((((..{,{{.((((({,,..,||||},.,|||,,{((,{{(,,,.(({|||}|}}}}.,,|{{||}}})|}||{|{{{,,.,,,..}|||}..,||||.{{{{{{|...})})))}....(((({{...}})}}|.((({...})))....,{,{{(....,{|},.}|||||||.((((.((((((.....{((((((((....((..........))...)))))))},)........)))))).)))).))....,))))}}}})))}..})}}||{(((((.((((..((((((((((((.,.((((.{.((((((((((.(((((......)))))}))))..........(((((((..((......))..)))))))......{((.(((........)))))}..,,,,,,({{{{{||,|,...|(({{{((((...,.,|((((.{({.,.((((((..((((((.........))))))..))))))..,,.)))}}},||||,|||,,{({.{{{{..........,,.}},||||{.|,|.|||.}}}},,|||.}}})))}...|{{{....,,|||,.||}}.,}}})).,))))).}))).....)))))....}.)))).,..))))))))))))..)))))))))}|(((((,,,.({.{,,,....}}..,,))}}}|,|||.,.||....|,.,,.(((((((,.,,.((((((........)))))){||.....}}}..,{{,{{(,........,,|,||||}}}.}),}}))},...|||||(({,{.{{.({{{{{...,,.{{{{{......((((......))))(((((((((.(((....))).))))}...,)))).,,,,,,))))),,),)))))),),..,)))}}}{{{{((((.,....})))}.)))),......
Forensic Context

No forensic context available.