Basic Information
Symbol
hsa_RIMS2_0001200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RIMS2_0197
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:104546360-104547022
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103534132-103534794
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-106.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-122.66 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
198.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((((((((.......(((......(((((((..(((((((((...)))))))))..(((((....)))))................)))))))))))))))))))))..((((((((((((.((((((((((((((((...))))).................((((((((((..((........))..)).))))))))..............(((((((...(((...........)))...)))))))...)))))))))))(((..(((.(((((.......))))))))..))).(((((((((((..((((((((....))))......(((((.(..((................))..).)))))..((((((...)))))).................))))..)))))).)))))...((((((((......(((...........)))......))))))))...............)).)))))).......))))((((..((((((....((((((.((((....))))...)).))))))))))))))..................((((((......))))))...)).((((((.((((..((.((((((....))))))..))..)))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...(((((((((((....,,|{||,..}},|||{,,,..(((((((((...)))))))))..(((((....)))))..{{{,....,,,...,,,}}}},||}}}}}}}}}}),.{,{{{(((({{{.{{{{{{{{{{{(((((...))))),....,,,{({......((((((((((..((........))..)),})))))))..,,..,,,.,|,.{{{|||{.,.(({.........,.|}}.,.}}}}}},...,,,}}}}}}}|(((..(({{{{(((.......))))))))..)))|{{(({{{|{{{..,,|{{({{....|||}..,)}}|.(((.,..}},..,{,...,,.....||,,,..,,{{{,((((({...}))))}.|,,.,,{{{.......))))}|}}}},|{|||||.,,{(((({{,......|||........,..}}}....,,|}}}}}}}.....,,,,..,.,,|}||}}}}}.......}}}},,,,}}||.,||}|}}||||{{.|{((.,,.}},,...,),,},)}))})))})|||},..,,,,........((((((......))))))...}).{(((((.((((,,,,.((((((....))))))..,),.)))).)))))}.
Forensic Context
No forensic context available.