Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0003700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RIMS2_0279
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:104778455-104943621 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103766227-103931393 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-507.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -550.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 589.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((........((((((.................((((((.((((..((((.(((((((......((((..........))))....((((.......))))((((((((((((............))).)))).))))).)))))))......((((((..(((....(((((......((((((((.(......))))))).)))))))....)))...)))))).))))......(((((((..((((....((..((((((((((((((((((..((((.(.(((((((((((...........))))).....)))))))...(((((((.............((....))..((((..((((..........((((.(......).))))....(((...(((((.(((((((......))))).)).)))))...)))...))))..))))........))))))).......((((((((.((((....))))...((((..((.(((((.......((((......))))......))))).))....))))........(((...(((((..((..((((.(..(((((.........)))))..).))))..))..)).)))......)))....))))))))..............((((((((...((((.....)))))))))).))...))))..)))))))))).(((((....))))).(((((....)))))....(((.((((...(((((.....)))))..)))).)))(((.....))).....(((((((((..((((.((..(((((((.(((...)))))))..))).((((((..((......((((((.......))))))............(((((((......)))))))(((..(((....)))...))).......(((((.(((((((((.........((((((...((........))...)))))).......................((....)).......((..(((..........)))..)).....))))))))).).)))).....))..))))))..............((((........)))).))))))..)).)))))))...(((((......))))))))))))).....)).....))))))))))).))))...))))))................(((((.((((((.(((....))))))).)).)))))))))))(((..(((((((.....))))))))))))))))))))((.....(((((....))))).(((((......)))))(((((((..........(((((...))))))))))))((((((((..(((((.......))))))))).))))(((.(((((((((..((((......))))(((((((.((.((((((.....))))))....(((((((...((((((((((.((((((((..(((((((.((.((.(((.((((((((((.(((.(((((.....((((((.((((((....)))))).................(((((.(((((((.((((((...)))))).))))..)))....)))))......................(((....)))..((((((...))))))...))))))((((...))))....))).)).)))))))).))))).))).)))))).)).)))((.((...)).)))))))))).)))))....)))))...)))))))..)))))))))..................(((((((((((((((((..(((.......((((..(((.......))))))).......)))..)))))))))))))))))((((((((...)))).))))((((..(....)..))))..............)))))))))..)))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,(({(((({{.....{(((,,,....,,,},,,,...{{{{{{({,,{{({{{{{{.||||||,....,,||||.....,}},.)))),..,||((.......,|||((((((((((((............))).)))).}}})),},,,)).......,,{{{{,.,,|,..}||||..,|.{{{{|,{{{(((({.(((.(((.....))).))).}))))((((((.(((((.{{,.,{{,.,,.,|||,,....,||||{((,{({{((({{{.||||...|||.}))},...|||||,..,..,....}}})),,,},)),))))))))))).............,.,||...,||,,{,,,,{(((((((({{(((..((((({.,((({(((.(((((,{{...(((((.(((((((......))))).)).)))))...|||({...{{((,{{{....,}},,}}}}}},,.....((((((((.((((....))))...((((..((.(((((.....,.((((......}))}....,.))))).))....)))}........(((...(((,{..((..((((.{..(((((.........)))))..}.))))..)),.}}.)))......)))....))))))))........))))))))|(((((,..((((.....))))))))),.,,),,)))))))))))))))))))||{....)))|,{(((((....)))))|{|{{(({((((,,{(((((,{{,,||}||..||||.,|,{{({{........}}}||{{||||{,,{,,,,((..((({(({.{((....))}}))..})}.((((((..((,.....((((((.......}))))}............(((((((......)))))))|||..{{{....}}}.,,),,..,,,,.(((((.(((((((((.,,..,,..((((((...{(,,,...}}))...))))))..............,........,{....|,.,,,,..{{..{{{,,,,.,,..,)},..)),}}..))))))))).).)))).....))..))))))..............((((........)))).}})))),,)),}}}||||.{.{({{{,.,,,,|))}}.},})))},|.....,(((((({{.(((((....{{...|,|.,.........,.........})))).|}))))))))}}})}}})),..,}))))))))))|{|,,{((((((.....})))))}|}},}}}}}}}}}{{,||..(((((....))))).{{{((,,,..,|||}|{{,{{{,...,,.,..}|||||...}))))},,}|||.{{({{{,..|||||,},...||||||||||{||||(((.{{,{{{{{{,.{{{{...,,,|}|}((((((,,,{.((({((,,...})))),...,{||||||.,.|||||(((((.(((((((((.{{(((((.,{.({.(((.((((((((((.(((.((({,...,(((((((.{{{(((..,,|}|||}......,,,}}}|,,..{((({.(((((((.((((((...)))))).)}))),}))....})))}..........,.,,...,,...(({....}))..((((((...))))))...))))))}{|,...}},.....})).)).))))))))}))))).))).}|,,,}.,}.}.)}))}....,}..})))))))).))))).,,,}))}}.}})))))))}}))))))))},..{,......,,.....(((((((((((((((((..{,{...,,,,((({.{(((.......))))))).....,,)))..)))))))))))))))))((((((((...)))),,)))||||,}|},,,}..)))),.............)))))))))..},,,.))
Forensic Context

No forensic context available.