Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0005500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RIMS2_0307
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
8:104892625-104922757 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103880397-103910529 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-419.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -452.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 400.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((....))....(((((........)))))....))(..(((((((..((...(((((.((((.((.(((((.((.((((((((((((((.......((((((((((.((((...(((......)))..)))))))).(((.(((((....(((.(((.((((.((.(((.....((((((.(((.(((.((..............((((.((((..((((((((((((.((((...(((((...)))))....))))))))))).))))).(((((((......((........))..((((.(((....)))))))..........)))))))...........((((((((((.(((..(((((..((((((((.(((((......(((((.(((((((......))))).)).)))))....((((...((((..((.....))..)))))))).....((((((((.((((....))))...((((..((.(((((.......((((......))))......))))).))....))))........(((...(((((..((..((((.(..(((((.........)))))..).))))..))..)).)))......)))....))))))))........)))))))))(((((...((((.....)))))))))....))))))))))))))))))))))))))..))))...(((((....)))))....(((.((((...(((((.....)))))..)))).)))(((((........))))).))))).)))))))))))).)))))).)))))))))))..)))....(.((((((........(((.(((......((((............(((((((......)))))))))))......)))))).........)))))).).)))))).....)))))))))))))))).)))))(((......(.((((............)))).)......)))......(((((((..(((.....)))..((((((((.((.(((((.............(((((((((((((.....((((.((((((((........))))...)))).))))........)))).((((.....))))....((.(((((.((........))))))).)).........(((.(((((((((((((((((((..((((....(((((.(.((((.....)))).).))....((((((((.(((...(((((((....)))))))..)))))))))))...........))).....))))..))))))))))))))))))))))(((((((((((((((.((.((((((((((((((...((((..........)))).....))))))))))))))((((((.((......)))))))).((((((.((......))))))))...)))))))))))).))))))))))))))...(((((...)))))))))).)).))))))))((((((((........))))))))......((((....))))...)))))))))))))))))))).)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.....((....}}.,,,(((((........)))))....))(..(((((((..((...(((((.((((.(((.(((((((((((((({((((,(({......,,,,,..(({,(({{,({{{{....,..,,,....,},{{,....{{(((..(((.((((,,...(((((((({((.{{.,,.{((((((((,.,..............}}}.,,}))))))},,,,,,{(((((((.((((((..(((((....))))).}.)))))).)))))))}},.,..}}.}}},.....,)})}))))..}},}))))))..))}.,,....},}..((....)}.......{(((((((({{{{(,.((((({.{(((((((.(((((,{{...(((((.(((((((......))))).)).)))))...|||({...{{((,{{{....,)},,}}}}}},,.....((((((((.((((....))))...((((..((.(((((.....,.((((......}))}......))))).))....)))}........(((...(((,{..((..((((.{..(((((.........)))))..}.))))..)),.},.)))......)))....))))))))........)))))))))(((((,..{(((.....))))))))),.|})},)))))}})))))))))))}(((....))),.{(((((....)))))}}}}||{.{|||,,,(((((.....)))))..||||.,|,{((((........))))).}))))}}),)))).))))}.,))))))))).)))......,,{,(.((({..((,.,...((((((.......}}||||......}}..})|||||(({{{{{.,,,,||(((({.,,,....,,}.,,|.,,,,,,,.(((((.(((((((((.,,,,||..((((((...,{|||...|,)}...))))))............,,|,.......,|,...,..,|||..{(..{{{.,.,.,,..,}||,,}}|,}..))))))))).).))))..(((((((((.((((,...((({.((((((((........))))...)))).}))}...{{(({{.|{,(({{....,)))).,..||}|||.{.{{...,,},.}}}},,),}}.......,,{((.(((((((((((((((((((..((((....,,{,({({((((.....}}}}.},}..,},((((((((.(((.{.(((((((....)))))))}.)))))))))))...,,,.....))}.....))))..)))))))))))))))))))})}((((((((((((((((((.((((((((((((((,{.((((.,.....,..)))).},..)))))))))))))){{((((.((......))))))}|.((((((.({......)))))))).}.)))))))))))).)))))))))))))),{,{((({,..,})))},,})))..||||||||,,,|||||,,,.)))}))))))))))....((((....))))...,,,,..,,.))))))))))).)))))))..)
Forensic Context

No forensic context available.