Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0006100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RIMS2_0270
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:104897526-104955154 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103885298-103942926 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-509.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -552.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 650.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((....((((((((((..(((..(((((((((((..(((((((.............((((.(((((..((((((.(......).)))).....((((.(((((.(((((((......))))).)).)))))....((((...((((..((.....))..))))))))....(((((((((.((((....))))..((((...(((((((((((((.(((((.....(.(((.((.(((((...((.(.((((...(((...(((...(((....((.((.((.......)).)).)).......))).......))))))))))).))....))))).)).))).).......((((...((((((((...((((.....)))))))))).))....))))...)))))))))))))..)))))))))(((((....)))))......((((((((((((((.((((((..((.((((....(((((........)))))..)))).)).........(((((((.(((...)))))))..))).((((((..((......((((((.......))))))............(((((((......)))))))(((..(((....)))...))).......(((((.(((((((((.........((((((...((........))...)))))).......................((....)).......((..(((..........)))..)).....))))))))).).)))).....))..)))))).....((((.((((((((........))))...)))).))))...((((((..(.((((.....)))).)..)))))).....(((((((((.(((((.........(.(.........).).........)))))..))))))))))))))).))))...))))))))))(((..(((((((.....)))))))))).)))))))))..)))).(((((....)))))(((.((((((.(((((........))))).)))))))))......))..))))).))))(((((((((((((...(((.(((((...((((((.......((((((.((....((((((((((...(.(.(((.((((....)))).))).).).....))))))).)))..)).))))))....((((((.((..((((((((((((....(.(.(((.((.((((........)))).)).))).).)....))))))))...(((((.(((((((.((((((...)))))).))))..)))....)))))...))))..))..))))))...(((....))))))))).))))).)))....)))))..))))))))......))).)))).)))))).)))))......(((((((...((((((((...((.(((....))).))(((((....)))))..(((((((((((.((((((((.....((((((......))))))))))))))............)))))))).)))(((((...)))))................(((((........)))))))))))))...)))))))(((.((((((..............((((((((((((........((.......)).........(((.....))).........((((((....(((((((........)))))))....))))))...(((((......)))))(((((...(((...(((..(((...)))))).)))...)))))....)))))))))))))))))).)))....(((((((...)))))))....((((((...)))))).((((...)))).....)))..)))))).))))))).))).((((.((((((.....(((((((((....((..........))...))))))).))........)))))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,.{({.,,,{{((((((({..{{({,(((({{{{{{{..{({{((,...},........((((.{((((,.{,((((.(......},}}}),,...{{{,.(((((.(((((((......))))).)).)))))...,||{{.,,||{{||||....,}},})))))),,....,{{{{{(((.((((..,,||||..{((...((((({({{,,{{{,,{,{{{,...,,{{(,((.(({((,,.{{...,,||....,,...((({{.((({{{,((..,.,,.|,.{((({,{....,.,||},}||,.,}}|{||}|||||||,,||,..{|}}},.}}.}}}.,...,,..((((...((((((((...((((.....)))))))))).))....))))..||||}||||}}|||{,.,}}|}||{(((((....))))),,,,,(({(((({{{(((((,{{{{||}||,.||||.,|,{((((........)))))||))))|,}||,,,|||,{{{(((,.(((,,,.}|||}}.,|||.((((((..((,.....((((((.......}})))}............(((((((......)))))))|||..{{{....}}}.,,),,..,,,,.(((((.(((((((((.,,..,,..((((((...{(,,,...}}))...))))))..............,........,{....|,.,,,,..{{..{{{,,,,.,,..,)},..)),}}..))))))))).).)))).....))..)))))).....,{,,.{{,,((((........))))...)))).}))},..||||,(,((({{..,,,,|||||.|,|||||||.....{((((((((.(((((....{{...,.{.........,.,.........))))).,}))))))))})))}}})),..,,))})))))))|{||,{((((((.....)))))))}}}.}}})}}}}}..})},.(((((....))))),{{,(({{{,.{{||||{{.,,,.,,,}}.},,)))|}}...}}}))},}}}}}.}}}}({{{{{||||{{{...((({(((((,,{((((((....,,.(((({(.((..,,(((,({(((({{.(.,.((({((,,...,)))),.,,}.})}}},.),))))).||||.||,|||||}...,(((((,.,(..(({{((((((((,,,{{,,.(((.{{.((((,,,,....||}}.}}.))),}.,....}))))))},..{{{{{.(((((((.((((((...)))))).)}}}},}))....})))}....,.},.},..}}}))}...(({....}))},||||{|,,,)}))),...)))))},})}}}}))......})).))}),))))))}}}))).},,.,({{{{{{...{|(({{{,..,{{,{||,|||}}.,}}|||||..,,,)}))},}}}||||||||.|||((({(.....{{{{{,...,,,||||||||||||||..,.....,,{,||||}|||{..,,,,,}}}}}}),,...,,}}}..,,,,,,|||||,,,,,,,,||||||}}}))))..,)))))))|||||{{..,}}}}.......{((((((((((((((...,....{|........,.........,{{.....,||.........{(((((....{((((((........)))))))....))))))...(((((,....,)))))|.,{(,{{{(({({(,,..{{|,,,)),})}...||{|}}}})),,.))))))))))))))),}}.}}),,|.||||,||,},))}))),.,.,|{||||,.})))))).||||..,)))}....,)))}.)}}))},))))))),))).||||,{{{|{{.,,.,|||{{{{{|..,,||,.....,,}.}),,,}))}})})}),,,.,,,,)))))).})}}.
Forensic Context

No forensic context available.