Basic Information

Symbol
hsa_chr8_0028200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RIMS2_0340
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
8:104898191-104922683 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:103885963-103910455 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-135.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -146.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 105.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.