Basic Information

Symbol
hsa_RIMS2_0033400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RIMS2_0154
Host gene
RIMS2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
8:105242944-105245834 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:104230716-104233606 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-678.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -737.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 604.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(((((.((....((((...((((.(((((.(((((((..((((((((....(((...(((.(((((((...(((((.(((.((...((((((((((...(((.(((((.((.((........)).))))))).)))(((((...)))))...............))))))))))...)).)))))))).....))))))).)))....................(((((((((((...((((........))))........((((((((.........((.....))........)))))))).......).))))))))))(((..((((....))))..))).....)))...)))))))).....)))))))...)))))..)).))...))))...(((((.(((((....((.((.((((.......)))).)).)).....))))).))))).....(((((((.(((((((...............(((....)))((((((..........((((((((..........((((((((((((....((((.(((((...........)))))))))........(((((((.(((((...............((((((.((..........((((((((.(((((......(((((((((((((..(((...)))))).))))))......(((((....)))))....((..((((((((((((............(((....)))........((((..((((((.......((((((((((((((..........)))))).((...((((((((.....))))))))...)).((((((..((((...(((((((..((((((...((.....))(((((.(((((.....))))).)))))..))))))))))))).)))))))))).(((((((((((((((((((((((........((.((((....)))).))..(((((.......)))))...................(((((...)))))..................(((((((((((......(((((.(((....))).)))))(((((..........((((((.((((((....)))))).))))))...)))))........(((((...)))))...(((.(((...(((((.((((((...(((.....((((((.(((.....((((((.(((((.........)))))))))))))).))..)))).....)))...))))))....))))).)))))))))))))))))....(((((...(((((..(((((....(((((..............((((((((((...))))))))))((((.((((((((.(((((((........((((((((......)))..)))))))))))).)))))))).))))......((((((.(((((((((((((((((((.......)))))))................(.(((.....))).)..)))))))))))).))))))(((....))))))))....)))))..)))))..)))))((((.((((...)))).))))))))))))))))).(((...........))).................)))).))))))((((((((.........)))))))).........))))))))........(((((.....)))))))))))...)))).))))))))))))..))...))))((((((...((((.((((((((((((.....)))))))))))))))).....))))))..)))))...))))))))..(((((.....))))).....((((..((((....))))..))))...((((.((.....((((((.......)))))).......)).))))...(((((((((((.....)))).)))))))......))))))))..))))).((((.((((((..(.((((((....(((.....)))((((((((...)))))))).)))))).).....)))))).)))).................)))))))((((((((...((.(((((((((((((.....))))))..)))))))...))..)))))))).......))))))))........((((((((.........((((.((((.......)))))))).........))))))))))))...................(((((((((.((((....(((((.....)))))....)))).))))))))).....((((.((((((((.(((.((....))...)))))))))))))))((((.((((.....))))))))...))))))))...................((((..(((((((((((.((.......((((..(((..((......))...)))))))..........((((....))))...........................)).))))).))))))))))...(((((..(((((.((....))))))))))))(((((((..((((((((.((((((..(((((((.......))))...)))....))))))))))....((((((...))))))....)))).)))))))....))))))..............))))))).)))))))..(((((((((.......((((((.(((((.....(((((((......))))))).....)))))))))))(((..((((((........))..))))..))).....(((((........)))))...))))))))).))))))).))))...))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({,,(((((.{{..{,((((.{,,{(({((({({.....{{,.((((((((({.((((({..{((((,(((.((({(,((((((.(((.....))).))))))....{((({{((.((........)).))))))}{{{{((({({{.|||||(,,{{........,,,||{{{{((,,,.}}}))))|{{({......}||||{{{,.....}}}},||||.....}||||(((((((.{.((((,,......}}}}....,,,,||||||||,,},............,,.}},,.,,)))}))))}}},...,.,,,,,,}}}}{({..{{{|....}))},.})),...}))))}.))))).,,)))))).)))))},}))))),)))))))),}},}...(((((.(((((....((.((.((((.......)))).)).)).....))))).))))).....(((((((.(((((({....}))........|{{....))}{(((((.{,,......((((((((.{{{{,....,,,,((((((((....((((.(((((...........)))))))))...(((...(((((((((.,(({(({...........,||{{{{,...,,.....((((((((.(((((,,,...(((((((((((((..{{{...}},))),})))))......(((((....)))))....({..((((((((((((.,..........{{{....}}}........((((.,{(((((.......((((((((((((((.........,||||||.((...((((((((.....))))))))...)).(((((,.,((((...(((((((..((((((...({.....}}(((((.(((((.....))))).)))))..))))))))))))).)))))))))).{(((((((({(((((((((((((...........,,{{{,..|}}|.({{.(((((.......)))))}}}....,.........,,(({{{....,,,,........,}}.......(((((((((((......(((((.(((....))).)))))(((((...,,,..,.{(((((.(({{{,..,,)))))}.))})},...)))))..,{{.,.(((((...))))).,.|||.(((...(((((.((((((.,.(((.....((((((.(((.....((((((.(((((.........)))))))))))))).))..)))).....))).,.))))))....))))).))),,,)))))))))))....{((({.{.{((((|.(((((.,..(((({.............,((((((((({...))))))))))|(((.((((((((.(((((((........(((((,((......,,),.)))))))))))).)))))))).)))}......((((((.{(((((((((((((((.,,...,,..,||||},|....,,}..}}}}..,.|{{...,}})},}..}}}))))))))}.))))))(((....))))))))....))))).}))))).,)))))((((.((((...)))).)))}))))))))))))).({(...........))}............,.,..)))).,)))}}((((((((,....,,..}))))))),,....,,.)))))))),,,,....{((({.....})))))}}},,.,.)))),))))))))))))..))...)))){(((({...((((.((((((((((((.....))))))))))))))))..,,,)}}))}}.)))))...))))))))..(((((.....))))).....((((..((((....))))..))))....})}}}),,,,..))))))).))...)))...........{{(((((.{{{{{{{((({.....}))).}}|||||{{{......,..{{{{{..{{.((((.(((((({.,.((((({....(((.....)))((((((({...}))))))).)))))).}.....)))))).)))).,,..}}}}},|,...}}}))))}}||.|})))},((.(((((((((((((.....))))))},)))))))...}}|{||||},})..}}}}.))))))))........((((((((.........{((,{((((.......)))))))}.........)))))))))}}},,.................(((((((((.((((.{,.(((((.....))))).,}.)))).)))))))))....{(((((((((((((.(((.((....))...)))))))))))))))|{((.{(({.....})))))))...))))))))...................((((..(((((((((((.((.......{{((..,{{..((,.....,}.,.))))))}.......,,,({,....,}))}...........................)).)))))))))))))))}...(((((..(((((.((....)))))))))))){((((((..((((((((.((((((..(((((((.......))))...)))....))))))))))....((((({...}))))}..,.)))).))))))),,..}))))}..|,.....,,...,,,)))).))))))).,{((((((((.......((((((.(((((.....(((((((......))))))).....)))))))))))(((..(((((,.,......},.}))))..))).....(((((........)))))...))))))))}.},})))).})})},.))))(.....)
Forensic Context

No forensic context available.