Basic Information

Symbol
hsa_RNF20_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087784 hsa_circRNF20_002
Host gene
RNF20
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:104302485-104303257 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:101540203-101540975 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-135.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -146.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.