Basic Information

Symbol
hsa_RTN4_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054596 hsa_circRTN4_004
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:55214627-55255356 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:54987491-55028220 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-666.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -717.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 717.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((...))))(((........(((.(((((((..(((.((((.((((((((((.((((((((((....((((.(((((((((...............))))((((((((((.........))))).)))))..))))).))))(((((.((.(((((.((...(((((((...((((((((((((((...........(((((((((....))).))))))...(((((.....)))))((((((.((((.....(((((....))))).((((((((((......(((((........)))))........((((.(((.......))).))))....(((((.....((((((((.(((((......((((...)))).......((.((...((((.(((((.((((((((((...........)))).((((.((.((((........)))).)))))).(((((((.(((((((......)))))))......)))))))....((.(((((((((((.((((...(((((........)))))..))))......((((((((((...(((((((((((((((((((((.(..(((...(((.((((.(((....((((....((((((.((((..(..((((......))))..)((((.(((((...((((((((((((((........))))..........)))))).).))).))))).)))).((((.((((..........))))...))))........))))))))))))))...))))))).)))...)))..))))...(((((((((.....)))))))))..........(((((........))..))).......)))))))))))).))))))...)))))(((..............)))........((.((((((((..((......(((((...........)))))................)))))))))).))))))).((((((((((.((((.....))))....))))............(((((((.......(((.((((....)))))))...(((((((........))).))))..(((((......(((.((((((.(((((..((...(((((....))).))...))......))))).))))))...))).....)))))...)))))))..))))))..)))))))))))))(((((((((((((.((((..(((.((((((((.....((((((((....((((((((((((((((.........(((.(....).))))))))))))))))))))))....(((((.........((((((((.((((....(((((....)))))..((((.((((......................))))))))((((...)))).......(((.((((....(((((.(...((.((((((.((............)))))))).))..........))))))...(((((.(((..(((.((((((....(((((......)))))((((...))))..........(((((....)))))...((((...(((....)))...))))........(((((((....((((((((((((..((((((.(((((((((((.(((((....))))).))))...)))..))))(((((...((..((......))..)).)))))(((..(((((((...)))))))..))))))))).)))..(((((((......((......))....(((((.(..((...))..).)))))))))))))))))))))..))))))).)))))).)))))).))))).)))).))))))).)))))))).....)))))..((((((......)))))))))))))))))))...))).))).).))..)))))))))))..)))))).))))).)))).)))).....))))).)))).))))......(((((((((..(((....)))..))))))))).........((((((((....))))))))..............((.(((.((.....((((((((...((((((((....))).....((....))...)))))...)))))))))).))).))..........)))))...))))))))))........((((.....))))..((((((.....))))))...)))))))))).....(((((..(((.........((((((((............(((((((((((.((...)).))))))))))))))))))))))...)))))..)))))).)))))))))))))))..............)).))))).)).)))))(((((....))))))))))))))).))))))..))))...(((((((((..((.(((((......)))).).)).......)))))))))...((((((..(((.(((..((((((((...((((.((.((((.((((((.((((.((......)).)))).)))..)))...)))).)).))))....))))...))))......))).)).)..)))))))))))))...)))))))..)))........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((........((((({{((((..(((((...((((.,,....,.))))...)))))..........{{{|.|||{{(,,(((,((({{.{|,|||{|||}|.{(((((((((.........))))).))))).((((((((((((((((((((((((...(((((.,.((..(((((.{(({.......}}},......(((((((((....))).))))))...(((((.....))))).,......,,...)))))..))..)))))...))))))))...,{{.(((((,{...,}.))))).}}}....((((.(((.......))).)))).....,((((.({{......}})}})},|,....((((...)))).......,..,....{{{...))}........(({{...........))}}.)))))))))},))},))}.,,..(((((((..(((((((.(((((((......)))))))......)))))))..)))))))..},,.{{((((,.{.....,}..}})})}}}|},..,}}},..}},}}))),.}}}..)|||||.,},)))))}}....)))))........)))(((({.((((((.(..((((((((.((((,,((({..{{({,.,..((({{(((((((,({(....((((({((,{{((,.,,,,..}}}|..........}})))).}}}.,.))))|||{{..(((,,((........))))))(((((.((((.......)))).))))).({..((.{{{....))).)}..))...}}}},(((((((((.....)))))))))......,))))))))}))..,..}),}}},.......{{(((({{((((((({,....,,,.((((....................................},}},.........}}))))))})))}).{{.((((((((((((((..((.(((((((((,,(((.{({({{.{(((.((((.....))))....}}}}....,,..,,..(((((((((((({((((,((((,...|||},|{,{{({(((({{{{{....,||.||||{{((((({(..{{(((.((,,,,.|||||}}}..}}}}.....}}))}.},...},......|||||.}}}}}|,,.,,,...||}.|||,,|||,,.||||{{|{,|||{{{,{{|||||,.((((((((((({(,((((..({{.(((({{{{.,,,.{{{{{|||....((((((((((((((((.........(((.{....}.))))))))))))))))))),,|....(((((.......,.((((((((.((((....(((((....))))}..((((.((((......................))))))))((((...)))).......(((.((((.,..{((({.{...{,.((((({,((............)))))))).,,..........}))))).,.{{(({.{{{..{{{.{{{{{,....(((({......})))}((((...)))),...,.,,,,(((((....)))))...((({...{{{....,)),,.}}}).,|,,...(((((((....(((((((((....,..((((((...,,(((((((((,,,.{{(|,|,.|||.....))}.,}},|||{,..{(({(,{.....,,}.,}.})))),.,.,.{((((((...)))))))}.}}))))))))),.))))))..}......,{......}},.{.(((((.(,.((...)),.),)))))},,....)))))))))..))))))).,)}))).})})}}.})))}.)))).))))))).)))))))).....))))}..{(((((,....,))))))))})))))))))),,.})).))).}.}},.})))))))))).(((((((.((((....))))...))))))).,,,.(((((,...}))))),{((((((..{{{....)))..))))))}||{{{{....,((((((((....))))))))}}...........,,..}||||,,,((((........)))))}}|{{....))).....}}}..}))...))))))))))))))}}..}}}}}|||,,...,))}...}}}},||||||,,,,,,..,...{{((.....}}}}.,{{{|{,.{{,,||||||,,,,|||||}},......|||||,}||||,......,{(((((((...,........(((((((((((,({...,,})))))))))))))))))))}}}...}}}},.|||||||.,},}})}}}))}},......})}}}|{{{..,,,.,.....,,||,|||,|}}}}.||||{{......,,}))))}((((({....,,}))))))))))},|}))))).}))}},..,,,..,))))))..))..))))))))))))).}).,,.)))))))))))))))))..).)))))).(((.((((.((......)).)))).)))..((((((((.,.((((.((.....(((((..((((((((....))))}})))))))).))))))...))).....)))))....}))))
Forensic Context

No forensic context available.