Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0853800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RTN4_0016
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:55209370-55215225 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:54982234-54988089 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-232.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -251.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 240.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.((((((((((.((((..((.((((((((((....(((((....)))))(((((((....)))))))...(((((.(.((((.......((..((.(((.((((((((((..........))))........(((((.((((.(........).)))).)))))...(((((((.........))))))).))))))((((((((.....((((.....))))....))))))))((....(((((((((((.((.........(((.......))).....(((((.....((((((((((((((.((....)).)))))...(((((((.....((........)).....))))))).(((((.........))))).........((((((((.(((((((((((((.....((((((.(((.((.......(((((((..((.......))..)).)))))...)).))).))))))......))))))...((((.(((.(((......))).))).)))).....((((........)))).((((..(((((((..............))))))))))).))))))((((......)))).((((..........))))....).)))))))).(((((((((.......(((...((((.....))))....)))............((((......))))..............................((((((.........))))))........)))))))))......)))))))))....)))))......)))))))))))))))..((((((..(((.....)))..)))))))))))..))......)))).).))))).....(((((...((((.(........).))))...))))).........))))))..)))).))..)))).)))))))))).))))))))))))((((..(((((......))))).......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((.((((((((((.((((.,{..((({((((((....{((((....))))|(((((({....})))))),..(((((.(.((((.....,,((,,((.((,,((((((,,,,.,,.,{{{,,||||,,{{{,..{((((.((((.({,...,,,..)))).)))}}...|,|||||,,|||,..,|}}}|||,}}}},,((((((((.....((((.....))))....)))))))),{|,..||{{{{{|||{(((.........,||..,},,.}})..,,.{{{{{.,.,.{{{{{{{|||||||.||....})})))))...(((((((.....((........)).....))))))).(((((.........)))))...,,....((((((((.,,{{{,,((((,,...}}||((((.{,,.(({.{{{{{((((((({,(({{.,,,.,,.,)).,))))..}))})},.}))),)}}}},.)))))),..((((.(((.(((......))).))).)))).....((((........}))).{(((..(((((((..............))))))))))}..||}||((((......))))}.|,,..........,}},....}.})))))}}.{{{{{{{{{..,,{|,{,,,,,((({.....))})....}}},...........((((......))))..................,...,.......{(((((..,......))))))........,}}}}}}},......}}}}}||||,{,.}}})),,,,,.}}))))))))))},,..((((({..|||.....}}}..))))))}))}}..))......)))).).))))).....(((((...((((.(........).))))...))))).........))))))..}))),}...)))).)))))))))).))))))))))))((({..,(((({{.{{.,,,,)}}}}}.,))))
Forensic Context

No forensic context available.