Basic Information
Symbol
hsa_RTN4_0005000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RTN4_0032
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:55237331-55237859
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:55010195-55010723
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-129.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-135.49 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
70.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........(((((((((.((...((((((.....))))))((((((((((.((((.((((.......(((((((...))))))).........)))).)))).....((((((....))))))............(((((....(((..((((.....))))..))))))))..((((.(((........................))).))))))))))))))......)).)))))))))((((.((((...)))))))))(((((((((......(((..(((((.((((..((......(((((((((....(((((..((......))..))))).....(((((......(((.......((((((((((....)))))))).)))))......)))))..(((((((...(((.........)))..)))).)))..(((....)))((((((((....)))))))).)))).)))))......))..))))...)))))...)))......)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(........(((((((((.{{...((((((.....))))))((((((((((.((((.((((.......(((((((...))))))).........)))).)))).....((((((....))))))............(((((....(((..((((.....))))..))))))))..((((.(((........................))).))))))))))))))......}}.)))))))))((((.((((...)))))))))(((((((((......(((..(((((.((((..((......(((((((((.,,,(((((..((......))..))))).......{((....}}}.,.......{{{,{,{{((,,..||}}}}||,||,,.}}}}}.||,|{{,(((((((...(((.........}}}..}))),},)))),,,,))))}((((((((....)))))))).)))).)))))......))..))))...)))))...)))......)))))))))
Forensic Context
No forensic context available.